Código Oficial: | M802 |
Sigla: | M:BFBP |
Descrição: | O Mestrado em Biologia Funcional e Biotecnologia de Plantas é um programa de formação avançada focado essencialmente na biologia molecular e celular das plantas, com uma forte componente de I&D+i em áreas que vão da agroalimentar à medicina, passando pelo ambiente e farmacêutica. Este curso privilegia a aquisição de competências em ferramentas moleculares que permitem o desenvolvimento de aplicações biotecnológicas inovadoras, bem como o contacto dos estudantes com o tecido empresarial nesse setor, estimulando o empreendedorismo de base tecnológica e a transferência de conhecimento para a sociedade. |
Os objectivos principais desta disciplina são fornecer aos alunos capacidade de lidar com todas as ferramentas bio-informáticas disponíveis para a planta que é considerada o modelo de estudo em biologia molecular.
Familiarizarem-se com técnicas avançadas de transformação de plantas, manuseamento de mutantes nulos simples e duplos e mutantes com genes marcados com diferentes tags. Recorrer a técnicas de emasculação e polinização de plantas, estudos semi in vivo do crescimento do tubo polínico e visualização de marcadores moleculares por microscopia de fluorescência e electrónica. Avaliação de resultados de Real Time-PCR e avaliação de resultados de RNA-seq.
Os alunos ficarão preparados para fazerem estágio em qualquer laboratório de Biologia Molecular assim como ficarão a par dos resultados mais recentes em Biologia da Reprodução de Plantas.
As plantas são a base de todos os ecossistemas terrestres, são essenciais para a homeostasia da biosfera e são também a base principal e última da alimentação humana. O nosso futuro e o do nosso planeta, mais do que de qualquer outro fator, dependem da gestão que fizermos do mundo vegetal e logo do nosso conhecimento profundo da biologia das plantas. A UC Biologia Molecular das Plantas tem como objetivo dar a conhecer as principais metodologias e estratégias moleculares, nomeadamente transcriptómicas e genómicas, utilizadas para desvendar a determinação genética da fisiologia e desenvolvimento das plantas, e como esse conhecimento pode ser utilizado para o melhoramento genético de plantas com importância para a humanidade. Os conteúdos da UC serão também trabalhados em contexto de casos de estudo e casos práticos (utilização “hands-on” de ferramentas in silico específicas), que permitirão uma melhor compreensão e funcionalização do conhecimento adquirido.
Compreender como crescem as árvores, a relação entre a estrutura da madeira e as propriedades específicas dos seus derivados; conhecer e aplicar os métodos de identificação de madeiras; compreender a importância da madeira enquanto recurso natural e matéria industrial e a sua importância nas diferentes sociedades.
A unidade curricular (UC) tem por objetivo geral desenvolver competências na criação de projetos de utilização das plantas para fins biotecnológicos, integrando uma componente teórica e uma forte componente de apresentação de casos de estudos e projectos, nacionais e internacionais, em desenvolvimento nessa área.
A UC tem por objetivo específico dar a conhecer as potencialidades e multifuncionalidades das coberturas verdes e capacitar os estudantes para a utilização dos diferentes materiais e possibilidades de aplicação destes sistemas no contexto atual de mitigação e adaptação às alterações climáticas.
É ainda objectivo específico da UC dar a conhecer os conceitos básicos em fitoremediação, os vários fatores bióticos e abióticos que podem limitar o sucesso dos processos de bio/fitoremediação e as especificidades de cada sistema.
Faz parte dos objectivos específicos desta UC a compreensão de fitotecnologias baseadas na interação entre plantas e microrganismos que melhoram o desempenho das plantas utilizadas para a recuperação de solos degradados e no aumento da produtividade vegetal, soluções sustentáveis com o objetivo de aumentar a produtividade das plantas e, ao mesmo tempo, reduzir as taxas de aplicação de fertilizantes químicos.
Será também objectivo da UC a apresentação de vários modelos de biomarcadores, baseados em plantas transgénicas, usadas com sucesso na biomonitorização de poluentes, os benefícios e possíveis desvantagens desses sistemas e ideias novas para as futuras gerações de fitosensores.
Após conclusão da UC, o estudante deve ser capaz de:
- Compreender a importancia das plantas como formas tecnologicas de preservação e remediação do meio ambiente (Biotecnologia verde).
- Classificar e caracterizar os diferentes tipos de coberturas verdes e identificar as suas vantagens ambientais/ecológicas, sociais e económicas.
- Estar capacitados para uma correta escolha e seleção dos sistemas e matérias para execução de coberturas verdes
- Compreender os principios gerais da utilização das plantas para fins de bioremediação de águas residuais ou solos e compreender as metodologias e tecnologia associada à estruturação de uma fitoetar.
- Compreender as bases teóricas inerentes à produção de biossensores e conhecer as aplicações atuais de alguns biosensores
- Conhecer as potencialidades de microorganismos com biofertilizantes e melhoradores da qualidade dos solos.
- Identificar diferentes tipos de fitotecnologias.
A maioria dos biólogos aborda o desenho experimental de maneira informal, ou ad hoc, refinando as suas experiências de forma empírica, numa base de tentativa-erro. Durante o curso será dada especial relevância à lógica subjacente a todo o processo experimental, desde a elaboração de hipóteses, selecção de testes estatísticos adequados às hipóteses em causa, planeamento e concepção da experiência e interpretação de resultados.
Fornecer conceitos avançados sobre manipulação de DNA, tecnologia de DNA recombinante, PCR, clonagem de genes e suas aplicações na transformação genética de plantas, na perspectiva de obtenção de proteínas recombinantes. Utilização de ferramentas básicas de bioinformática no planeamento experimental para a obtenção de proteínas recombinantes (BLAST search, análise de sequências, desenho de primers, optimização de codões). Prática laboratorial incidindo na clonagem de genes em vectores de expressão adequados contendo tags e proteínas de fusão, e transformação de estirpes bacterianas geneticamente adequadas.
Objetivos - aquisição de conhecimentos sobre os processos fisiológicos e bioquímicos subjacentes aos danos causados por stresses abióticos e bióticos e sobre as respostas de aclimatação e de adaptação das plantas; identificar estratégias para aumentar a tolerância das plantas a diferentes tipos de stress.
Após conclusão da UC, o estudante deverá ser capaz de:
- compreender aspetos da fisiologia das plantas envolvidos nas interações planta-meio
- reconhecer a influência do clima e solo nas plantas
- explicar como fatores ambientais podem ser responsáveis por graves situações de stress
- reconhecer as principais respostas e adaptações das plantas a diferentes situações de stress
- conhecer os principais mecanismos fisiológicos e bioquímicos que protegem as plantas contra stresses
- compreender a importância da UC para a resolução de problemas ambientais no atual contexto de alterações climáticas
Objetivos gerais:
Desenvolver uma visão integrada da estrutura e funcionamento dos genomas, transcriptomas e proteomas e conhecer as modernas metodologias associadas à genómica funcional, incluindo sequenciação, anotação, análise in silico de bases de dados funcionais, transcriptómica e princípios gerais de bioinformática.
Objetivos específicos:
- Comparar os genes e família de genes entre plantas modelo como Arabidopsis thaliana e espécies de interesse agrícola; conhecer recursos de genómica comparativa.
- Utilizar as principais ferramentas de análise in silico/bioinformáticas para a caracterização de genes e proteínas em plantas.
- Analisar dados de expressão de genes por RNA-Seq de forma a caracterizar genes diferencialmente expressos.
- Utilizar ferramentas de interpretação e análise de dados de proteína. Caracterizar proteínas quanto a parâmetros bioquímicos, previsão de localização subcelular e de modificações pós-traducionais, previsão de estrutura 3D.
- Conhecer princípios fundamentais da análise bioinformática; experimentar a utilização de linhas de comandos em ambiente LINUX.
A unidade curricular tem por objetivo desenvolver competências na área da criação de novos projectos empresariais na área das ciências da vida, integrando uma componente teórica e uma forte componente prática. A apresentação e discussão de conceitos e metodologias, terá como objectivo a sua aplicação na validação do potencial de mercado de um projecto empresarial concreto na área das biociências, criado pelos estudantes.
No final da unidade curricular, os estudantes devem:
Fornecer aos alunos conhecimentos básicos sobre culturas de células vegetais in vitro e aplicações práticas, nomeadamente micropropagação e transformação de plantas.
Fornecer aos alunos conhecimentos básicos de manipulação em assépsia.
O melhoramento de plantas, que acompanha historicamente a humanidade, possui hoje em dia a necessidade de dar resposta a enormes desafios. Este incluem, entre outros, o rápido crescimento da população, a necessidade de implementação de práticas ambientais sustentáveis, e a resposta às alterações climáticas. O objetivo da UC em Melhoramento Genético de Plantas (MGP) consiste em providenciar uma introdução abrangente e diversificada a diferentes aspetos que regem o melhoramento genético de plantas. A UC incorpora aspetos de melhoramento genético clássico, bem como vertentes de melhoramento de base genómica, ou de melhoramento de precisão por edição de genomas, na interface com a potenciação dos recursos genéticos vegetais, com a biotecnologia e a translação de conhecimento fundamental.
Durante um período normal de 1 ano, e como peça basilar da sua formação, o estudante deverá desenvolver um projecto de investigação original num domínio fundamental ou aplicado da Biotecnologia ou Biologia Funcional de Plantas. Deste trabalho resultará a elaboração de uma dissertação final que constituirá a peça fundamental da avaliação do estudante. Deste trabalho deverão resultar ainda publicações em revistas internacionais com sistema de arbitragem científica.
Alternativa o estudante poderá realizar um estágio numa empresa e elaborar um relatório final que constituirá a base da sua avaliação.
Durante um período normal de 1 ano, e como peça basilar da sua formação, o estudante deverá desenvolver um projecto de investigação na área da Biotecnologia ou Biologia Funcional de Plantas no âmbito empresarial. Deste trabalho resultará a elaboração de um relatório final que constituirá a peça fundamental da avaliação do estudante. Deste trabalho poderão resultar ainda publicações em revistas internacionais com sistema de arbitragem científica.
A UC projecto tem como objectivo fundamental o desenvolvimento teórico daquele que deverá vir a constituir o projecto de investigação conducente à elaboração da dissertação de mestrado. Nesta UC será desenvolvido no estudante aptidões e competências para a elaboração de um projecto científico com uma forte componente experimental numa área adequada ao âmbito do CE.
A UC projecto de estágio tem como objectivo fundamental o desenvolvimento teórico daquele que deverá vir a constituir o projecto de estágio conducente à elaboração do relatório de estágio de mestrado. Nesta UC será desenvolvido no estudante aptidões e competências para a elaboração de um projecto científico com uma forte componente experimental numa área adequada ao âmbito do CE.