O laboratório desenvolve a sua atividade em duas frentes:

1) Investigação científica, que inclui estudos sobre consequências biológicas decorrentes do uso de antimicrobianos e dispersão ambiental de bactérias multirresistentes, bem como a avaliação da atividade antimicrobiana de diversos compostos

2) Prestação de serviços, que inclui microbiologia clínica, testes de identificação bacteriológica e da avaliação da suscetibilidade aos antimicrobianos em amostras clínicas recolhidas em animais de companhia, e ainda microbiologia alimentar e análise bacteriológica de águas de consumo.