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Genética Aplicada

Código: RM26     Sigla: GA

Áreas Científicas
Classificação Área Científica
OFICIAL Biologia e Ecologia Marinhas

Ocorrência: 2025/2026 - 2S (de 16-02-2026 a 31-07-2026) Ícone do Moodle

Ativa? Sim
Unidade Responsável: Microscopia
Curso/CE Responsável: Mestrado em Ciências do Mar - Recursos Marinhos

Ciclos de Estudo/Cursos

Sigla Nº de Estudantes Plano de Estudos Anos Curriculares Créditos UCN Créditos ECTS Horas de Contacto Horas Totais
MCMRM 4 Plano Oficial 2018 1 - 5 50 135

Docência - Responsabilidades

Docente Responsabilidade
Paula Maria Vieira Jorge Regente
Elsa Maria Branco Froufe Andrade Regente

Docência - Horas

Teórica: 2,14
Práticas Laboratoriais: 1,43
Tipo Docente Turmas Horas
Teórica Totais 1 2,143
Elsa Maria Branco Froufe Andrade 1,143
Paula Maria Vieira Jorge 1,00
Práticas Laboratoriais Totais 1 1,429
Elsa Maria Branco Froufe Andrade 1,072
Paula Maria Vieira Jorge 0,357

Língua de trabalho

Português e inglês
Obs.: Slides em inglês

Objetivos

Fornecer aos estudantes conhecimentos gerais que os permita entender o fascinante mundo da genómica populacional e sua aplicação para compreender a evolução adaptativa em organismos marinhos. Exploraremos como a genómica nos permite associar a variação génica a características fenotípicas que permitem que a vida marinha prospere em ambientes diversos e em constante mudança.
Elsa Froufe, PhD (ORCID: https://orcid.org/0000-0003-0262-0791), uma investigadora de elevado prestígio, com vasta experiência em ecologia e evolução aquática, será co-docente desta disciplina. A Dra. Froufe possui um extenso currículo de publicações, tendo dedicado seus esforços recentes à investigação do impacto das alterações climáticas sobre a biodiversidade aquática. Esta é uma oportunidade única para os alunos aprenderem diretamente com uma autoridade líder no campo da biologia molecular marinha.
Este curso proporciona aos estudantes uma compreensão abrangente das técnicas de biologia molecular e suas aplicações na conservação marinha. Os alunos desenvolverão as capacidades práticas necessárias para realizar experiências laboratoriais, assim como sentido crítico exigido para interpretar resultados e contribuir para a investigação científica. Esta UC também incentiva o sentido de responsabilidade ambiental e um compromisso com a preservação dos ecossistemas marinhos.

Resultados de aprendizagem e competências

As capacidades, conhecimentos e atitudes desenvolvidos ao longo das aulas podem ser aplicados em diversas áreas, como a investigação, gestão ambiental e educação.

Conhecimentos:

  • Conhecimento sobre os diferentes tipos de marcadores moleculares utilizados em estudos de diversidade genética e identificação de espécies.
  • Compreensão dos desafios da conservação de espécies e populações marinhas, bem como dos sucessos e fracassos de diferentes estratégias de conservação
  • Conhecimento das técnicas moleculares mais utilizadas em estudos de diversidade genética de organismos marinhos, incluindo NGS, metabarcoding, eDNA, RNAseq e low-coverage genome
  • Capacidade de analisar e interpretar dados moleculares, utilizando ferramentas bioinformáticas

Capacidades:

  • Capacidade de realizar, analisar e interpretar resultados de diferentes técnicas moleculares, resolução de problemas e de trabalho em equipa
  • Avaliação crítica da literatura e resultados experimentais
  • Comunicação de resultados de forma clara e concisa, tanto em formato oral quanto escrito

Atitudes:

  • Interesse em aprender mais sobre a biologia molecular e a conservação marinha.
  • Consciência da importância de realizar experiências de forma responsável e ética.
  • Valorização da importância da conservação da biodiversidade marinha

Modo de trabalho

Presencial

Programa

Noções teóricas e desenvolvimento de atividades laboratoriais nas seguintes àreas:
- extração manual e automática de ADN de organismos marinhos: frescos, enlatados e processados;
- eletroforese e amplificação por PCR de marcadores moleculares para estudo de diversidade genética e identificação de espécies;
- introdução à análise e interpretação de resultados para avaliar o sucesso da amplificação e a potencial variação genética de espécies marinhas;
- métodos moleculares aplicados e estudos de diversidade genética de organismos marinhos;
- tecnologias de ponta (NGS) que desempenham um papel na conservação marinha, including metabarcoding, eDNA, RNAseq, low-coverage genome
Estudos de Caso:
1 - sucessos da conservação dentro da mesma espécie;
2 - desafios da conservação enfrentados por diversas populações marinhas;
3 - aplicação de tecnologias de NGS no estudo da conservação marinha.

Bibliografia Obrigatória

Van Oppen, M.J. and Coleman; Advancing the protection of marine life through genomics, PLoS Biology, 20(10), p.e3001801, 2022
Antil, S., Abraham, J.S., Sripoorna, S., Maurya, S., Dagar, J., Makhija, S., Bhagat, P., Gupta, R., Sood, U., Lal, R. and Toteja, R.,; DNA barcoding, an effective tool for species identification: a review., Molecular biology reports, 50(1), pp.761-775., 2023
Tan, M.P., Wong, L.L., Razali, S.A., Afiqah-Aleng, N., Mohd Nor, S.A., Sung, Y.Y., Van de Peer, Y., Sorgeloos, P. and Danish-Daniel, M.,; Applications of next-generation sequencing technologies and computational tools in molecular evolution and aquatic animals conservation studies: A short review, Evolutionary Bioinformatics, 15, p.1176934319892284., 2019
Goodwin, S., McPherson, J.D. and McCombie, W.R.,; Coming of age: ten years of next-generation sequencing technologies, Nature reviews genetics, 17(6), pp.333-351., 2016
Froufe, E., Gomes-dos-Santos, A., Matos, A., Wilson, J., Malakpourkolbadinezhad, S., Pereira, D.D., Singer, R. and Castro, L.F.C.,; How complex is the hidden species diversity of the teleost Plotosus genus?. , Ichthyological Research, 71(1), pp.163-173., 2024

Métodos de ensino e atividades de aprendizagem

Aprendizagem Baseada em Problemas:

Casos reais de conservação marinha que envolvam as técnicas aprendidas em aula
Trabalho em grupos para investigar o problema, propor soluções e apresentar resultados

Integração de Tecnologias:

Utilizar softwares de análise de dados para interpretar resultados de sequenciamento e identificar marcadores moleculares
Consultar bancos de dados de sequências para comparar os resultados obtidos com sequências conhecidas
Visita ao CIIMAR:
Para que os estudantes possam observar as técnicas realizadas na prática e interagir com investigadores

Palavras Chave

Ciências Naturais > Ciências biológicas > Biologia > Genética
Ciências Naturais > Ciências biológicas > Biodiversidade > Biologia da conservação
Ciências Naturais > Ciências do ambiente > Ciências da terra > Ciências marinhas

Tipo de avaliação

Avaliação distribuída sem exame final

Componentes de Avaliação

Designação Peso (%)
Participação presencial 10,00
Apresentação/discussão de um trabalho científico 70,00
Trabalho escrito 10,00
Trabalho laboratorial 10,00
Total: 100,00

Componentes de Ocupação

Designação Tempo (Horas)
Apresentação/discussão de um trabalho científico 20,00
Frequência das aulas 20,00
Estudo autónomo 20,00
Trabalho escrito 20,00
Trabalho laboratorial 20,00
Total: 100,00

Obtenção de frequência

Avaliação da UC: O desempenho dos alunos será avaliado com base nos seguintes critérios: assiduidade, entrega pontual dos trabalhos atribuídos, entrega bem-sucedida dos projetos finais e qualidade do poster de investigação.
O poster deve demonstrar uma compreensão abrangente das técnicas de biologia molecular e sua aplicação em estudos de biodiversidade marinha.

Fórmula de cálculo da classificação final

A nota final será calculada considerando três componentes: presença (10%), participação (20%) e trabalho final (70%).

O resultado final será arredondado para o número inteiro mais próximo (máximo 20 valores). O estudante será considerado aprovado se obtiver uma nota final igual ou superior a 10 valores.
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