Cláudio Viegas Júnior concluiu em 1994 a Licenciatura em Química Industrial e, em 1994, o Mestrado em Química, na área de Síntese Orgânica, ambos pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Em 2003 concluiu o Doutoramento em Química, na área de Química de Produtos Naturais/Química Medicinal, pela Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho". Em 2006 obteve o Pós-Doutoramento em Química Medicinal.

Com uma vasta carreira como docente e investigador, é atualmente coordenador científico do Laboratório de Pesquisa em Química Medicinal – PeQuiM – onde desenvolve uma linha de investigação na área da Química Medicinal, com particular foco no planeamento, síntese e avaliação farmacológica de novos candidatos a fármacos analgésicos, anti-inflamatórios, antimicrobianos, antiparasitários, antiproliferativos, neuroativos e contra a COVID-19 e anti-SARS-COV-2.