Técnicas e Aplicações de Biologia Celular e Molecular em Ciências do Mar

Código:

CMRM114

Sigla:

CMRM114

Áreas Científicas
Classificação	Área Científica
OFICIAL	Ciências do Mar

Ocorrência: 2011/2012 - 1S

Ativa?	Sim
Unidade Responsável:	Microscopia
Curso/CE Responsável:	Mestrado em Ciências do Mar - Recursos Marinhos

Ciclos de Estudo/Cursos

Sigla	Nº de Estudantes	Plano de Estudos	Anos Curriculares	Créditos UCN	Créditos ECTS	Horas de Contacto	Horas Totais
MCMRM	9	Espec. em Biologia e Ecologia Marinhas 2008	1	-	5	50	135
		Espec. em Aquacultura e Pescas 2008	1	-	5	50	135

Língua de trabalho

Português

Objetivos

Familiarizar os estudantes com os vários tipos de técnicas utilizadas para analisar amostras biológicas em Biologia Celular e Molecular. Recordar e esclarecer os estudantes sobre os princípios teóricos que estão na base de cada técnica, bem como, exemplificar algumas das suas aplicações mais comuns em biologia. Possibilitar a aprendizagem recorrente da experiência do “saber fazer” no que diz respeito a técnicas muito usadas em biologia celular e molecular. Assim, no final das actividades, o estudante deverá mostrar que possui conhecimento, compreensão, capacidade de execução e competência nas áreas relativas a várias técnicas estereológicas, citológicas, histológicas (microscopia, óptica, electrónica e de fluorescência) e moleculares. Um dos objectivos é também facultar a experiência de trabalhar em grupo para a resolução de problemas.

Programa

INTRODUÇÃO À ESTEREOLOGIA
História. A importância da quantificação. Parâmetros-alvo. Medidas em órgãos, células e organelos.
TÉCNICAS CITOLÓGICAS
Princípios gerais da citologia. Manuseamento das amostras. Preparação das amostras. Coloração das amostras citológicas. Observação citológica.
TÉCNICAS HISTOLÓGICAS
Recepção e manuseamento das amostras. Fixação dos tecidos. Processamento dos tecidos. Corte dos tecidos incluídos em parafina. Corte de tecidos criofixados. Coloração.
TÉCNICAS DE COLORAÇÃO ESPECIAIS
Impregnação argêntica, método de Bielschowsky's para fibras nervosas e axónios. Tricrómio de Masson para fibras de colagénio. Impregnação metálica, método de Gomori para fibras reticulares. Colorações especiais para lípidos. Colorações de Nissl para o tecido nervoso. Coloração de Weigert para fibras elásticas.
IMUNOHISTOQUÍMICA
Introdução. Produção de anticorpos. Preparação do tecido. Visualização dos produtos finais da reacção. Métodos imunocitoquímicos/Técnicas. Aplicações.
HISTOQUÍMICA
Introdução. Histoquímica qualitativa e quantitativa. Técnicas preparatórias. Métodos histoquímicos. Aplicações
MICROSCOPIA ELECTRÓNICA DE TRANSMISSÃO
Introdução. Processamento do tecido. Ultramicrotomia. Coloração e contrastação. Criotécnicas
Observação ao microscópio. Imunocitoquímica e histoquímica.
HIBRIDIZAÇÃO IN-SITU
Introdução. Tipos de sondas. Preparação do tecido e pré-tratamento da amostra
Revelação dos híbridos. Contrastação e modos de observação. Aplicações
IMUNOFLUORESCÊNCIA
Introdução. Antigénios. Métodos para preservação dos antigénios. Selecção dos anticorpos.
Imunofluorescência. Aplicações
CONCEITOS TEÓRICOS SOBRE BIOLOGIA MOLECULAR
DNA, RNA, transcrição, tradução, código genético, proteína
Estrutura do gene, exons, introns, promotores, mecanismos reguladores
Evolução molecular, homologia/analogia
Aplicações de biologia molecular exemplos
BIOINFORMÁTICA/ LABORATÓRIO RNA
Bioinformática: Notas introdutórias; GenBank e Ensembl; Recursos genómicos; Alinhamentos, Regiões conservadas; Filogenia; Exercício prático.
Laboratório RNA: Notas introdutórias; Extracção do RNA, concentração, avaliação da qualidade, síntese de cDNA
PCR DE TEMPO REAL
Notas introdutórias sobre os princípios básicos da técnica
Exercício laboratorial com o RTPCR
Discussão dos resultados
Alternativas: métodos avançados de expressão molecular.

Bibliografia Obrigatória

Material distribuido pelos docentes.

Métodos de ensino e atividades de aprendizagem

Aulas Expositivas
Aulas Práticas

Tipo de avaliação

Avaliação distribuída com exame final

Componentes de Avaliação

Descrição	Tipo	Tempo (Horas)	Peso (%)	Data Conclusão
Participação presencial (estimativa)	Participação presencial	50,00
	Total:	-	0,00

Fórmula de cálculo da classificação final

Nota Final = Nota do Exame Final + Nota do Trabalho (1) + Nota do Trabalho (2).

O Exame Final (com consulta) é cotado até 10 valores. Cada Trabalho é cotado até 5 valores. Haverá uma bonificação de até 0,5 valores para trabalhos escritos e apresentados em língua inglesa.

Provas e trabalhos especiais

(1) Apresentação oral de 2 artigos científicos, que estejam relacionados com um problema específico que será apresentado aos estudantes sob a forma de projecto passível de ser executado ao longo da unidade curricular: 1 exemplo na área de biologia celular (5 min) e 1 exemplo na área da biologia molecular (5 min). Os mestrandos terão de dialogar no sentido em que não haverá lugar a apresentação de exemplos que possam ser considerados, na prática, iguais. O trabalho é realizado em grupos de 2 - no dia da apresentação será sorteado quem apresenta o quê.

(2) Elaboração de 1 "Relatório do Projecto" individual e que integre as seguintes secções: Resumo; Introdução; Material e Métodos; Resultados; Discussão e Bibliografia. Cada estudante terá que apresentar oralmente (5 min) uma das técnicas que foi utilizada no projecto ou uma técnica que, apesar de não ter sido utilizada, poderia ter dado um contributo importante para a resposta à questão proposta. Na apresentação deve indicar: o objectivo da técnica; os resultados obtidos (ou esperados) com a aplicação da mesma; o contributo obtido (ou esperado) da técnica para este projecto específico e exemplos de outras situações em que esta técnica poderia ter sido aplicada.


Nota: O ultrapassar dos tempos de apresentação será negativamente reflectido na classificação.

Observações

Outros colaboradores do ICBAS que intervirão na leccionação: Fernanda Malhão, Célia Lopes e
Ana Silva