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Bioinformática

Código: EBE0122     Sigla: BIOI

Áreas Científicas
Classificação Área Científica
OFICIAL Engenharia Biomédica

Ocorrência: 2010/2011 - 1S

Ativa? Sim
Curso/CE Responsável: Mestrado Integrado em Bioengenharia

Ciclos de Estudo/Cursos

Sigla Nº de Estudantes Plano de Estudos Anos Curriculares Créditos UCN Créditos ECTS Horas de Contacto Horas Totais
MEB 5 Plano de estudos oficial 1 - 5 42 135
MIB 19 Plano de estudos oficial 4 - 5 42 135
PRODEB 1 Plano de estudos oficial 1 - 5 42 135

Língua de trabalho

Português

Objetivos

A disciplina tem por objectivo dotar os alunos da capacidade de:
1. utilizar recursos Web e ferramentas informáticas para estudos de Evolução Molecular
2. compreender os algoritmos subjacentes às ferramentas de utilização frequente em Biologia
Molecular.
3. Conhecer e saber utilizar algoritmos de Análise Automática de dados para problemas de Biologia.

Ainda falta inserir a informação relativa à parte leccionada pelo Vítor Costa.

Programa

1. Evolução Molecular
Conceitos básicos de Evolução Molecular e Genética das Populações
Métodos Filogenéticos
Bases de dados biológicas
2. Algoritmos para:
Alinhamento
Alinhamento de Pares de Sequências
Alinhamentos Múltiplos
Árvores Filogenéticas
Expressão de genes
3. Algoritmos de Análise Automática de dados para problemas de Biologia Molecular
Algoritmos de Classificação e sua a aplicação em Proteómica e Drug Design racional
Algoritmos de Clustering e sua aplicação em problemas de Biologia Molecular.

Bibliografia Obrigatória

Douglas J. Futuyma; Evolution, INCPublishers, 2005
Daan Frenkel e B. Smit; Understanding Molecular Simulation, Academic Press, 2002
Andrew Leach; Molecular Modelling: Principles and Applications, Prentice Hall
Arieh Y. Ben-Naim; Statistical Thermodynamics for Chemists and Biochemists, Plenum Press, 1992
Neil C. Jones e Pavel A. Pevzner; An Introduction to Bioinformatics Algorithms, MIT Press, 2004

Métodos de ensino e atividades de aprendizagem

As aulas teóricas são usadas para exposição formal da matéria, acompanhada da apresentação
de exemplos e sua discussão. Nas aulas práticas será realizado um trabalho de grupo versando um
tema sobre Evolução Molecular.

Tipo de avaliação

Avaliação distribuída sem exame final

Componentes de Avaliação

Descrição Tipo Tempo (Horas) Peso (%) Data Conclusão
Participação presencial (estimativa) Participação presencial 39,00
Total: - 0,00

Fórmula de cálculo da classificação final

A classificação final é repartida da seguinte forma:
50%
40% relatório na área da Evolução Molecular
10% para a impressão do professor sobre o (des)empenho do aluno nas aulas práticas.

Avaliação especial (TE, DA, ...)

Os alunos que frequentam ao abrigo de estatutos especiais têm os mesmos requisitos de avaliação
de frequência dos alunos regulares, devendo realizar os trabalhos práticos propostos e fazer a sua
demonstração nas épocas estabelecidas.

Melhoria de classificação

A classificação distribuída só pode ser melhorada frequentando de novo a disciplina num ano
lectivo posterior.
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