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Bioinformática Molecular

Código: Q4100     Sigla: Q4100     Nível: 400

Áreas Científicas
Classificação Área Científica
OFICIAL Química

Ocorrência: 2024/2025 - 2S Ícone do Moodle

Ativa? Sim
Unidade Responsável: Departamento de Química e Bioquímica
Curso/CE Responsável: Mestrado em Bioinformática e Biologia Computacional

Ciclos de Estudo/Cursos

Sigla Nº de Estudantes Plano de Estudos Anos Curriculares Créditos UCN Créditos ECTS Horas de Contacto Horas Totais
E:BBC 0 PE_Bioinformática e Biologia Computacional 1 - 6 42 162
M:BBC 9 Plano estudos a partir de 2018 1 - 6 42 162

Docência - Responsabilidades

Docente Responsabilidade
Pedro Manuel Azevedo Alexandrino Fernandes Regente

Docência - Horas

Teorico-Prática: 3,23
Tipo Docente Turmas Horas
Teorico-Prática Totais 1 3,23
André Alberto de Sousa Melo 0,355
Pedro Manuel Azevedo Alexandrino Fernandes 0,568
António José Meireles Ribeiro 2,307

Língua de trabalho

Português - Suitable for English-speaking students

Objetivos

Pretende dar-se aos alunos uma visão abrangente de temas da Bioinformática Molecular actual. Adicionalmente, nas aulas práticas, os alunos são encorajados a desenvolver pequenos projectos de investigação.

Resultados de aprendizagem e competências

Domínio das diversas ferramentas da Bioinformática Molecular. Capacidade de identificar compostos bioativos por varrimento virtual. Capacidade para modelar estruturas de macromoléculas. Capacidade em estudar computacionalmente a reactividade de sistemas (bio)químicos. Sentido crítico e consciência na escolha das ferramentas informáticas mais adequadas ao estudo de cada problema da bioquímica.

Modo de trabalho

Presencial

Programa

Aulas Teóricas

1. Estrututura e modelação de proteínas.
2. Mecânica molecular.
3. Docking proteína-ligando. 
4. Screening virtual.
5. Mutagénese computacional.
6. Estrutura Electrónica e Reactividade enzimática.

Aulas Práticas

Desenvolvimento de pequenos projectos de investigação nas áreas abrangidas pelos conteúdos das aulas teóricas.

Bibliografia Obrigatória

João Marques Sousa, Matilde Ribeiro Viegas, Pedro Teixeira Ferreira, Pedro Coelho Paiva, Ana Luísa Oliveira, Pedro Alexandrino Fernandes, Maria João Ramos; Bioinformática Molecular- Conceitos Fundamentais, Faculdade de Ciências, Universidade do Porto, 2022
João Marques Sousa, Matilde Ribeiro Viegas, Pedro Teixeira Ferreira, Pedro Coelho Paiva, Ana Luísa Oliveira, Pedro Alexandrino Fernandes, Maria João Ramos; Bioinformática Molecular- Tutoriais, Faculdade de Ciências, Universidade do Porto, 2022

Métodos de ensino e atividades de aprendizagem

Aulas teóricas, por vezes de exposição, por vezes apoiadas em workshops dadas com computador operados pelos alunos.
Aulas práticas dadas em laboratório de computação operadas pelos alunos em computador (um aluno por computador).

Tipo de avaliação

Avaliação distribuída com exame final

Componentes de Avaliação

Designação Peso (%)
Exame 50,00
Trabalho prático ou de projeto 50,00
Total: 100,00

Componentes de Ocupação

Designação Tempo (Horas)
Elaboração de relatório/dissertação/tese 36,00
Estudo autónomo 84,00
Frequência das aulas 42,00
Total: 162,00

Obtenção de frequência

Participação de 75% das aulas práticas.

Fórmula de cálculo da classificação final

A Nota Final da disciplina de Bioinformática Molecular consiste na média da soma da nota obtida no exame final e da nota obtida aulas práticas e correspondente relatório realizado pelo aluno.

Nota Teórica
A nota teórica é dada pela nota do exame teórico final cuja data é fixada pelo Conselho Pedagógico da F.C.U.P. O seu valor é de 50% da nota final. Para obter aprovação na unidade curricular o estudante deverá ter uma classificação mínima de 7 valores no exame teórico.

Nota Prática
A nota prática corresponde à avaliação de um relatório do trabalho de investigação realizado nas aulas práticas. 

Avaliação especial (TE, DA, ...)

Os estudantes com circunstâncias especiais devem discutir a sua situação com o responsável da unidade curricular.

Melhoria de classificação

Repetição do exame final.

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