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Bioinformática Molecular I

Código: Q4088     Sigla: Q4088     Nível: 400

Áreas Científicas
Classificação Área Científica
OFICIAL Química

Ocorrência: 2024/2025 - 2S Ícone do Moodle

Ativa? Sim
Unidade Responsável: Departamento de Química e Bioquímica
Curso/CE Responsável: Mestrado em Aplicações em Biotecnologia e Biologia Sintética

Ciclos de Estudo/Cursos

Sigla Nº de Estudantes Plano de Estudos Anos Curriculares Créditos UCN Créditos ECTS Horas de Contacto Horas Totais
M:ABBS 7 Plano de estudos a partir de 2019/20 1 - 3 21 81

Docência - Responsabilidades

Docente Responsabilidade
Pedro Manuel Azevedo Alexandrino Fernandes Regente

Docência - Horas

Teórica: 0,77
Práticas Laboratoriais: 0,85
Tipo Docente Turmas Horas
Teórica Totais 1 0,769
André Alberto de Sousa Melo 0,152
Pedro Manuel Azevedo Alexandrino Fernandes 0,243
Pedro Miguel Teixeira Ferreira 0,374
Práticas Laboratoriais Totais 1 0,846
Pedro Miguel Teixeira Ferreira 0,416
Pedro Manuel Azevedo Alexandrino Fernandes 0,265
André Alberto de Sousa Melo 0,165

Língua de trabalho

Português e inglês
Obs.: A língua de ensino será o Português se todos os estudantes pertencerem a países de língua oficial portuguesa. Caso contrário, a língua de ensino será o Inglês.

Objetivos

Pretende dar-se aos alunos uma visão abrangente de temas da Bioinformática Molecular atual, em aulas de exposição.
Adicionalmente, em aulas práticas, os alunos são encorajados a desenvolver pequenos protocolos sobre os temas de investigação abordados nas aulas de exposição.

Resultados de aprendizagem e competências

Domínio das diversas ferramentas da bioinformática. Capacidade para modelar estruturas de macromoléculas. Capacidade de modelar complexos através de encaixe molecular.  Sentido crítico e consciência na escolha das ferramentas informáticas mais adequadas ao estudo de cada problema da bioquímica.

Modo de trabalho

Presencial

Programa

Aulas Teóricas
1. Modelação por homologia e optimização de geometria de proteínas.
2. Ancoragem molecular proteína-ligando.

 
Aulas Práticas
Desenvolvimento de protocolos incidindo sobre os conteúdos das aulas teóricas.

Bibliografia Obrigatória

João Marques Sousa, Matilde Ribeiro Viegas, Pedro Teixeira Ferreira, Pedro Coelho Paiva, Ana Luísa Oliveira, Pedro Alexandrino Fernandes, Maria João Ramos; Bioinformática Molecular- Conceitos Fundamentais, Faculdade de Ciências, Universidade do Porto, 2022
João Marques Sousa, Matilde Ribeiro Viegas, Pedro Teixeira Ferreira, Pedro Coelho Paiva, Ana Luísa Oliveira, Pedro Alexandrino Fernandes, Maria João Ramos; Bioinformática Molecular- Tutoriais, Faculdade de Ciências, Universidade do Porto, 2022

Métodos de ensino e atividades de aprendizagem

Aulas teóricas, por vezes de exposição, por vezes apoiadas em workshops dadas com computador operados pelos alunos.
Aulas práticas dadas em laboratório de computação operadas pelos alunos em computador (um aluno por computador).

Tipo de avaliação

Avaliação distribuída sem exame final

Componentes de Avaliação

Designação Peso (%)
Trabalho prático ou de projeto 50,00
Exame 50,00
Total: 100,00

Componentes de Ocupação

Designação Tempo (Horas)
Estudo autónomo 42,00
Frequência das aulas 21,00
Trabalho escrito 18,00
Total: 81,00

Obtenção de frequência

Frequência de 75% das aulas práticas, apresentação de um relatório (75%) do trabalho realizado nas aulas práticas, apresentação de um pequeno trabalho escrito (15%) e apresentação oral do mesmo (10%).


Fórmula de cálculo da classificação final

A nota final da disciplina de Bioinformática Molecular I consiste na soma das notas teórica e prática:

-Nota Teórica
A nota teórica corresponde a 50% da nota obtida no exame final. A classificação mínima no exame teórico para obter aprovação na unidade curricular é de 7 valores.

-Nota Prática
A nota prática corresponde à classificação de um relatório (50% da nota final) relativo ao trabalho de investigação realizado nas aulas práticas.

Melhoria de classificação

Oral realizada sobre a matéria teória e prática dada na disciplina.
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