Microbiologia Ambiental  

Código:

BIOL3017

Sigla:

BIOL3017

Nível:

300

Áreas Científicas
Classificação	Área Científica
OFICIAL	Biologia

Ocorrência: 2023/2024 - 1S

Ativa?	Sim
Unidade Responsável:	Departamento de Biologia
Curso/CE Responsável:	Licenciatura em Biologia

Ciclos de Estudo/Cursos

Sigla	Nº de Estudantes	Plano de Estudos	Anos Curriculares	Créditos UCN	Créditos ECTS	Horas de Contacto	Horas Totais
L:B	93	Plano de Estudos Oficial	3	-	6	48	162

Língua de trabalho

Português - Suitable for English-speaking students

Objetivos

Resultados de aprendizagem e competências

I - Saber interpretar e comentar criticamente trabalhos em Microbiologia Ambiental e as metodologias envolvidas.

II – Desenvolver competências laboratoriais básicas relacionados com as diferentes  temáticas de Microbiologia Ambiental abordadas nas aulas práticas.

III – Desenvolver competências de trabalho individual e em equipa, nomeadamente pesquisa bibliográfica; capacidade expositiva e de síntese de temas de Microbiologia Ambiental.  

Modo de trabalho

Presencial

Pré-requisitos (conhecimentos prévios) e co-requisitos (conhecimentos simultâneos)

Conhecimentos básicos de microbiologia geral.

Programa

Programa teórico

Introdução à Microbiologia Ambiental.

I - Microbiologia do solo. Microbiologia dos ciclos biogeoquímicos do carbono e azoto. Importância dos microrganismos na decomposição de matéria orgânica no solo. Microbiologia da rizosfera e do rizoplano (e.g. micorrizas, fungos endófitos). Os actinomicetos.

II - Microbiologia da água. Os diferentes ambientes aquáticos e as comunidades microbianas associadas.
Doenças bacterianas transmitidas pela água: cólera, salmonelose, e a doença do legionário. Exemplos de importantes epidemias e pandemias. Infecções gastrointestinais provocadas por  enterobacteriaceas (E. coli, Shigela sp., entre outras). Microrganismos indicadores da qualidade da água. Limitações. Legislação.
Intoxicações gastrointestinais causadas por cianobactérias.
Infecções víricas transmitidos pela água.

III - Microbiologia das atmosferas.
Doenças bacterianas transmitidas pela atmosfera: peste pneumónica, carbúnculo, e legionelose. Ciclos de vida e ecologia dos agentes etiológicos. Descrição sumária dos quadros clínicos. Profilaxia e terapéutica.
Doenças respiratórias fungícas, e.g. aspergilose.
Infecções respiratórias víricas. Inluenza e coronavirus.
Importância da epidemiologia na compreensão das doenças respiratórias. O triângulo epidemiológico. Conceitos em epidemiologia (surto/epidemia/pandemia/incidência/taxas de morbilidade e mortalidade/etc).
Métodos de análise microbiológica das atmosferas.
Microbiologia das atmosferas e bioterrorismo.

IV - Microbiologia dos ambientes extremos. Microrganismos halofílicos. Microrganismos xerofílicos. Microrganismos psicrofílicos e termofílicos. Habitats e adaptações fisiológicas e estruturais.
Microbiologia dos ambientes extremos e os fundamentos da astrobiologia.  Análises dos solos da Lua e de Marte. Teoria da Panspermia? Microbiologia aeroespacial: experiências microbiológicas no espaço.

V - Microbiologia dos ambientes poluídos. Microbiologia do petróleo. Os micróbios como agentes de despoluição. Grandes desastres ecológicos. Microbiologia dos organoclorados. As dioxinas e o DDT. Microbiologia da borracha. Microbiologia dos plásticos.

VI - Microbiologia dos metais. A toxicidade relativa dos metais. Mecanismos moleculares de toxicidade. Microbiologia do arsénio e do mercúrio. Mecanismos de toxicidade e de resistência. Contaminação ambiental, desastres ecológicos e suas consequências.

Programa prático

MICROBIOLOGIA DA ÁGUA. Análise de amostras de água colhidas em vários pontos do estuário do Rio Douro. As bactérias indicadoras da qualidade microbiológica da água: níveis de coliformes fecais e enterococos. Enumeração de bactérias cultiváveis totais e bactérias resistentes a antibióticos.

MICROBIOLOGIA DE AMBIENTES POLUÍDOS. Experiência de biodegradação de petróleo. Prática do Número Mais Provável de microrganismos degradadores. Isolamento de bactérias degradadoras.

MICROBIOLOGIA DE AMBIENTES EXTREMOS: Estudar as comunidades de microrganismos procariotas que habitam ambientes extremos hipersalinos com o objetivo de distinguir microrganismos halófilos obrigatórios de microrganismos halotolerantes e intolerantes ao sal, assim como analisar a diversidade e estrutura taxonómica do microbioma halófilo de salinas.

MICROBIOLOGIA DO AR: Isolamento e quantificação de bactérias e fungos em amostras de ar exterior e interior. Avaliação de parâmetros microbiológicos da qualidade do ar.

Bibliografia

Environmental microbiology. 3rd edition, 2015. Pepper, I.L., Gerba, C.P., & Gentry, T.J. Eds. Amsterdam : Elsevier/AP, cop. 2015. ISBN 978-0-12-394626-3

Standard methods for the examination of water and wastewater. 18th edition, 1992. Greenberg, A.E., Clesceri, L.S. & Eaton, A.D. Eds. Washington: American Public Health Association. ISBN 978-0-87553-207-3

Manual of environmental microbiology. 2nd edition, 2002. Hurst, C. J., Crawford, R.L., Knudsen, G. R., McInerney, M. J., & Stetzenbach, L. D. Eds. Washington: ASM Press, ISBN 978-1-55581-199-0

Brock biology of microorganisms. 12th edition, 2009. San Francisco: Pearson/Benjamin Cummings, cop. 2009. Rev. ed. of: Brock biology of microorganisms / Michael T. Madigan. 11th ed. 2006. ISBN 978-0-321-53615-0

Prescott's principles of microbiology. 2009. Willey, J. M., Sherwood, L.M.& Woolverton, C.J. - Boston: McGraw-Hill Higher Education. ISBN 978-0-07-337523-6

Referências bibliográficas mais específicas serão indicadas aos estudantes no decurso das aulas.

Bibliografia Obrigatória

Ian L. Pepper; Environmental microbiology. ISBN: 978-0-12-394626-3
Christon J. Hurst; Manual of environmental microbiology. ISBN: 978-1-55581-199-0
Arnold E. Greenberg; Standard methods for the examination of water and wastewater. ISBN: 978-0-87553-207-3

Bibliografia Complementar

Joanne M. Willey; Prescott.s principles of microbiology. ISBN: 978-0-07-337523-6
Michael T. Madigan; Brock biology of microorganisms. ISBN: 978-0-321-53615-0

Métodos de ensino e atividades de aprendizagem

Aulas teóricas de cariz essencialmente expositivo, mas que favoreçam e incentivem a participação dos estudantes.

Aulas práticas consistirão na preparação, execução, e interpretação e discussão dos resultados de trabalhos laboratoriais representativos da temática da disciplina. As actividades laboratoriais desenvolver-se-ão preferencialmente em grupos de quatro estudantes de modo a desenvolverem competências de trabalho em equipa.

Será disponibilizado um manual de trabalhos práticos para que a prática laboratorial possa ser executada pelos grupos de trabalho de forma mais independente possível.

Os resultados obtidos deverão ser tratados e analisados dentro do grupo para serem apresentados pelos diferentes grupos à turma e discutidos em conjunto.

As plataformas SIGARRA, MOODLE e/ou TEAMS serão usadas como suporte das aulas teóricas e práticas.

Tipo de avaliação

Avaliação distribuída com exame final

Componentes de Avaliação

Designação	Peso (%)
Exame	70,00
Apresentação/discussão de um trabalho científico	30,00
Total:	100,00

Componentes de Ocupação

Designação	Tempo (Horas)
Frequência das aulas	48,00
Estudo autónomo	114,00
Total:	162,00

Obtenção de frequência

De acordo com o Art10º da Avaliação dos discentes de primeiros ciclos de estudo da Universidade do Porto, aprovado pelos despachos reitorais GR.02/05/2010 e GR.04/01/2017, determina-se que para a obtenção de frequência a esta UC, o estudante não deve exceder o número limite de faltas correspondente a 25% das aulas laboratoriais.

Estão dispensados desta obrigatoriedade os estudantes abrangidos pelas situações previstas na lei, sem porejuizo do disposto do nº 3 do Art11º do referido regulamento.

Fórmula de cálculo da classificação final

EX - Exame - 70% (14 valores)  (Observações: exame sobre os conteúdos da matéria teórica (55%) e teórico-prática (15%)         

VP - Apresentação/discussão de um trabalho científico -  30% (6 valores) (Observações: trabalho de grupo os trabalhos laboratoriais realizados nas aulas práticas, editado de acordo com orientações a serem fornecidas aos estudantes)

Classificação Final = EX + VP

Provas e trabalhos especiais

Não tem.

Trabalho de estágio/projeto

Não tem.

Avaliação especial (TE, DA, ...)

Não tem.

Melhoria de classificação

Apenas a componente de avaliação relativa ao Exame (70%) é passível de melhoria de nota.

Observações

Júri da UC: Fernando Tavares (regente) e Catarina Magalhães