Modelação de Bioestruturas
Áreas Científicas |
Classificação |
Área Científica |
OFICIAL |
Química |
Ocorrência: 2018/2019 - 1S ![Requerida a integração com o Moodle Ícone do Moodle](/fcup/pt/imagens/MoodleIcon)
Ciclos de Estudo/Cursos
Língua de trabalho
Português - Suitable for English-speaking students
Objetivos
Estudar propriedades físicas, químicas, biológicas e estruturais das proteínas e DNA. Conhecer os Princípios de catálise enzimática. Usar técnicas computacionais para o estudo estrutural e funcional dos sistemas moleculares abordados, e previsão das propriedades abordadas.
Resultados de aprendizagem e competências
Ao concluir esta unidade curricular, o estudante deve ser capaz de:
- descrever a estrutura e as propriedades de todos os aminoácidos que incluem as proteínas naturais.
- estar familiarizado com a estrutura molecular de proteínas e os motivos 3D que elas adotam em cada nível de organização estrutural.
- compreender os princípios básicos da ação catalítica de enzimas e os mecanismos de interação com substratos.
- descrever a estrutura molecular do DNA e as noções básicas da sua replicação e desnaturação.
- compreender algumas interações comuns entre DNA e proteínas.
Modo de trabalho
Presencial
Programa
Programa das Aulas Teóricas 1. Interações moleculares em química biológica. 2. Biomoléculas- síntese, estrutura e propriedades. 3. Dos aminoácidos às proteínas. 4. Estrutura primária, secundária, terciária e quaternária de proteínas. 5. Visualização computacional no estudo de proteínas. 6. Catálise e inibição enzimática. 7. Ácidos nucleicos.
Programa das AULAS PRÁTICAS I. Introdução geral ao LINUX. II. Obtenção de informação científica - PDB (protein databank) - Artigos (Web of science) - Ferramentas de análise do PDB via web III. Técnicas básicas utilizadas na visualização de moléculas (software VMD) IV. Estrutrutura das proteínas V. Simulação computacional da desnaturação do DNA.
Bibliografia Obrigatória
Buckberry Lorraine D.;
Essentials of biological chemistry. ISBN: 9780471489061
Métodos de ensino e atividades de aprendizagem
Aulas teóricas complementadas com trabalhos práticos computacionais usando software específico em ambiente Linux.
Tipo de avaliação
Avaliação distribuída com exame final
Componentes de Avaliação
Designação |
Peso (%) |
Apresentação/discussão de um trabalho científico |
50,00 |
Exame |
50,00 |
Total: |
100,00 |
Componentes de Ocupação
Designação |
Tempo (Horas) |
Apresentação/discussão de um trabalho científico |
10,00 |
Estudo autónomo |
30,00 |
Frequência das aulas |
30,00 |
Trabalho laboratorial |
30,00 |
Total: |
100,00 |
Obtenção de frequência
Condições de Frequência: Comparência ao número mínimo de aulas práticas legalmente obrigatório (75% do número de aulas previstas).
Fórmula de cálculo da classificação final
Fórmula de avaliação: A Nota Final é calculada da seguinte forma: (50% nota prática) + (50% nota teórica). Nota prática = nota de apresentação oral dos trabalhos práticos. Nota teórica = nota do exame teórico.
Avaliação especial (TE, DA, ...)
Os estudantes com regime especial podem realizar uma única avaliação prática no final do semestre, para obterem a nota prática.
Melhoria de classificação
Só pode ser feita melhoria da componente teórica da classificação, através da realização de um exame de melhoria de nota.