Modelação de Bioestruturas
Áreas Científicas |
Classificação |
Área Científica |
OFICIAL |
Química |
Ocorrência: 2017/2018 - 1S
Ciclos de Estudo/Cursos
Língua de trabalho
Português - Suitable for English-speaking students
Objetivos
Estudar propriedades físicas, químicas, biológicas e estruturais das proteínas e DNA. Conhecer os Princípios de catálise enzimática. Usar técnicas computacionais para o estudo estrutural e funcional dos sistemas moleculares abordados, e previsão das propriedades abordadas.
Resultados de aprendizagem e competências
Ao concluir esta unidade curricular, o estudante deve ser capaz de:
- descrever a estrutura e as propriedades de todos os aminoácidos que incluem as proteínas naturais.
- estar familiarizado com a estrutura molecular de proteínas e os motivos 3D que elas adotam em cada nível de organização estrutural.
- compreender os princípios básicos da ação catalítica de enzimas e os mecanismos de interação com substratos.
- descrever a estrutura molecular do DNA e as noções básicas da sua replicação.
- compreender algumas interações comuns entre DNA e proteínas.
Modo de trabalho
Presencial
Programa
Programa das Aulas Teóricas 1. Interações moleculares em química biológica. 2. Biomoléculas- síntese, estrutura e propriedades. 3. Dos aminoácidos às proteínas. 4. Estrutura primária, secundária, terciária e quaternária de proteínas. 5. Visualização computacional no estudo de proteínas. 6. Catálise e inibição enzimática. 7. Ácidos nucleicos.
Programa das AULAS PRÁTICAS I. Introdução geral ao LINUX. II. Obtenção de informação científica - PDB (protein databank) - Artigos (Web of science) - Ferramentas de análise do PDB via web III. Técnicas básicas utilizadas na visualização de moléculas (software VMD) IV. Estudo e manipulação gráfica de modelos de aminoácidos e proteínas V. Simulação computacional de Dinâmica Molecular no estudo da interação entre uma enzima e substrato. (software Amber e VMD)
Bibliografia Obrigatória
Buckberry Lorraine D.;
Essentials of biological chemistry. ISBN: 9780471489061
Métodos de ensino e atividades de aprendizagem
Aulas teóricas complementadas com trabalhos práticos computacionais usando software específico em ambiente Linux.
Tipo de avaliação
Avaliação distribuída com exame final
Componentes de Avaliação
Designação |
Peso (%) |
Apresentação/discussão de um trabalho científico |
50,00 |
Exame |
50,00 |
Total: |
100,00 |
Componentes de Ocupação
Designação |
Tempo (Horas) |
Apresentação/discussão de um trabalho científico |
10,00 |
Estudo autónomo |
30,00 |
Frequência das aulas |
30,00 |
Trabalho laboratorial |
30,00 |
Total: |
100,00 |
Obtenção de frequência
Condições de Frequência: Comparência ao número mínimo de aulas práticas legalmente obrigatório (75% do número de aulas previstas).
Fórmula de cálculo da classificação final
Fórmula de avaliação: A Nota Final é calculada da seguinte forma: (50% nota prática) + (50% nota teórica). Nota prática = nota de apresentação oral dos trabalhos práticos. Nota teórica = nota do exame teórico.
Avaliação especial (TE, DA, ...)
Os estudantes com regime especial podem realizar uma única avaliação prática no final do semestre, para obterem a nota prática.
Melhoria de classificação
Só pode ser feita melhoria da componente teórica da classificação, através da realização de um exame de melhoria de nota.