Bioinformática

Código:

IM2014_18

Sigla:

Bioinf

Áreas Científicas
Classificação	Área Científica
OFICIAL	Informática Médica

Ocorrência: 2017/2018 - 2S

Ativa?	Sim
Página Web:	http://www.dcc.fc.up.pt/~pribeiro/aulas/bioinformatica1718/
Unidade Responsável:	Departamento de Ciência de Computadores
Curso/CE Responsável:	Mestrado em Informática Médica

Ciclos de Estudo/Cursos

Sigla	Nº de Estudantes	Plano de Estudos	Anos Curriculares	Créditos UCN	Créditos ECTS	Horas de Contacto	Horas Totais
MIM	6	Plano de Estudos em vigor	1	-	3	27	81

Língua de trabalho

Português - Suitable for English-speaking students

Objetivos

Fornecer ao aluno ao aluno a capacidade de compreender os principais conceitos e técnicas presentemente usadas na importante área de Biologia Computacional, e também de poder contribuir na resolução de novos problemas na área.

Resultados de aprendizagem e competências

Pretende-se que o aluno:
1 se familiarize com os conceitos básicos de Bioinformática, com especial ênfase na Biologia Molecular Computacional;
2 conheça e compreenda os tipos e fontes de dados usados e os problemas computacionais mais importantes;
3 entenda os algoritmos mais importantes e interessantes, em particular no emparelhamento de sequências, filogenia e reconhecimento de padrões (no genoma, proteoma e redes de interação);
4 tenha uma perspectiva das ferramentas mais populares e das questões abertas na área.

Modo de trabalho

Presencial

Programa

Problemas Computacionais em Biologia Molecular.
Revisão dos Conceitos Fundamentais da Biologia Molecular.
Assemblagem de Genomas.
Alinhamento de Pares de Sequências e Alinhamentos Múltiplos.
Árvores Filogenéticas.
Biologia de Sistemas e Análise de Redes Biológicas.

Bibliografia Obrigatória

Durbin Richard 070; Biological sequence analysis. ISBN: 0-521-62971-3

Bibliografia Complementar

Deonier Richard C.; Computational genome analysis. ISBN: 0-387-98785-1

Métodos de ensino e atividades de aprendizagem

Aulas teórico-práticas com exposição da matéria, acompanhada de exemplos, e com uso de ferramentas existentes.

Tipo de avaliação

Avaliação distribuída com exame final

Componentes de Avaliação

Designação	Peso (%)
Apresentação/discussão de um trabalho científico	30,00
Exame	30,00
Trabalho prático ou de projeto	40,00
Total:	100,00

Fórmula de cálculo da classificação final

A avaliação tem em conta as seguintes componentes:

- Apresentação de Artigo (A): peso 30%
- Projecto (P): peso de 40% (opcional)
- Exame Escrito Final (E): peso entre 30% a 70%

A classificação final da unidade curricular obtém-se da seguinte forma:

A*30% + máximo(E*70%, E*30% + P*40%)