Química Biológica Computacional

Código:

Q254

Sigla:

Q254

Áreas Científicas
Classificação	Área Científica
OFICIAL	Química

Ocorrência: 2011/2012 - 2S

Ativa?	Sim
Unidade Responsável:	Departamento de Química e Bioquímica
Curso/CE Responsável:	Licenciatura em Química

Ciclos de Estudo/Cursos

Sigla	Nº de Estudantes	Plano de Estudos	Anos Curriculares	Créditos UCN	Créditos ECTS	Horas de Contacto	Horas Totais
L:Q	38	Plano de estudos Oficial	2	-	5	-

Língua de trabalho

Português

Objetivos

Estudo de propriedades físicas, químicas, biológicas e estruturais das proteínas e ADN. Princípios de catálise enzimática. Uso de técnicas computacionais para o estudo e previsão das propriedades abordadas.

Programa

Programa das Aulas Teóricas

1. Interacções moleculares em química biológica.
2. Biomoléculas- síntese, estrutura e propriedades.
3. Dos aminoácidos às proteínas.
4. Estrutura primária, secundária, terciária e quaternária de proteínas.
5. Visualização computacional no estudo de proteínas.
6. Catálise e inibição enzimática.
7. Ácidos nucleicos.


Programa das AULAS PRÁTICAS

I. Introdução geral ao LINUX
II. Obtenção de informação científica
- PDB (protein databank)
- Artigos (Web of science)
- Ferramentas de análise do PDB via web
III. Técnicas básicas utilizadas na visualização de moléculas
(software VMD)
IV. Estudo e manipulação gráfica de modelos de aminoácidos e proteínas
III. Simulação computacional de Dinâmica Molecular no estudo da interacção entre uma enzima e substrato.
(software Amber e VMD)


BIBLIOGRAFIA

1. Protein Structure and Function, G.Petsko and D Ringe, Oxford Univ. Press
2. Essential BIochemistry por Charlotte Pratt and Kathleen Cornely, John Wiley and Sons,

3. Textos próprios de apoio disponíveis na página web desta unidade curricular.

Bibliografia Obrigatória

G.Petsko and D Ringe; Protein Structure and Function, Oxford Univ. Press

Bibliografia Complementar

Charlotte Pratt and Kathleen Cornely; Essential BIochemistry, John Wiley and Sons
Mike Williamson; How Proteins Work, Garland Science, Taylor & Francis Group, 2012. ISBN: 978-0-8153-4446-9

Métodos de ensino e atividades de aprendizagem

.

Software

Amber e VMD

Tipo de avaliação

Avaliação distribuída com exame final

Componentes de Avaliação

Descrição	Tipo	Tempo (Horas)	Peso (%)	Data Conclusão
Participação presencial (estimativa)	Participação presencial	68,00
	Total:	-	0,00

Obtenção de frequência

Comparência ao número mínimo de aulas práticas legalmente obrigatório (75% do número de aulas previstas).

Fórmula de cálculo da classificação final

A Nota Final é calculada da seguinte forma:

(50% nota prática) + (50% nota teórica).

Nota prática = média aritmética das duas avaliações práticas realizadas ao longo do semestre, aferida com informação obtida pelo professor ao longo dos trabalhos

Nota teórica = nota do exame teórico

Em nenhuma das duas componentes a nota poderá ser inferior a 6,0 valores.

Provas e trabalhos especiais

.

Avaliação especial (TE, DA, ...)

Os estudantes com regime especial podem realizar uma única avaliação prática no final do semestre, para obterem a Nota prática.

Melhoria de classificação

Só pode ser feita melhoria da componente teórica da classificação, através da realização de um exame de melhoria de nota.