Comparative context analysis of codon pairs on an ORFeome scale

• Tipo: Artigo em Revista Científica Internacional
• Data: 2005

Autores

Moura, G (Autor) Outra; Pinheiro, M (Autor) Outra; Raquel M Silva (Autor) Outra; miranda, im (Autor) Outra; Afreixo, V (Autor) Outra; Dias, G (Autor) Outra; Freitas, A (Autor) Outra; Oliveira, JL (Autor) Outra; Santos, MAS (Autor) Outra

Revista

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Título: ACM International Conference Proceeding Series

Vol. 6

Página Final: R28

Editora: Association for Computing Machinery

Indexação

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Outras Informações

ID Authenticus: P-000-5S7

DOI: 10.1186/gb-2005-6-3-r28

Abstract (EN): Codon context is an important feature of gene primary structure that modulates mRNA decoding accuracy. We have developed an analytical software package and a graphical interface for comparative codon context analysis of all the open reading frames in a genome (the ORFeome). Using the complete ORFeome sequences of Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe, Candida albicans and Escherichia coli, we show that this methodology permits large-scale codon context comparisons and provides new insight on the rules that govern the evolution of codon-pair context.

Idioma: Inglês

Tipo (Avaliação Docente): Científica

Nº de páginas: 14