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Publicações

Additional SNPs improve risk stratification of a polygenic hazard score for prostate cancer

Título
Additional SNPs improve risk stratification of a polygenic hazard score for prostate cancer
Tipo
Artigo em Revista Científica Internacional
Ano
2021
Autores
Newcomb, LF
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Gamulin, M
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Usmani, N
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Claessens, F
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Gago Dominguez, M
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Townsend, PA
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Roobol, MJ
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Zheng, W
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Mills, IG
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Andreassen, OA
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Dale, AM
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Seibert, TM
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Karunamuni, RA
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Huynh Le, MP
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Fan, CC
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Thompson, W
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Eeles, RA
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Kote Jarai, Z
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Muir, K
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Lophatananon, A
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Schleutker, J
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Pashayan, N
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Batra, J
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Gronberg, H
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Walsh, EI
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Turner, EL
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Lane, A
(Autor)
Outra
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Martin, RM
(Autor)
Outra
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Neal, DE
(Autor)
Outra
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Donovan, JL
(Autor)
Outra
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Hamdy, FC
(Autor)
Outra
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Nordestgaard, BG
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Tangen, CM
(Autor)
Outra
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MacInnis, RJ
(Autor)
Outra
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Wolk, A
(Autor)
Outra
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Albanes, D
(Autor)
Outra
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Haiman, CA
(Autor)
Outra
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Travis, RC
(Autor)
Outra
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Stanford, JL
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Mucci, LA
(Autor)
Outra
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West, CML
(Autor)
Outra
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Nielsen, SF
(Autor)
Outra
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Kibel, AS
(Autor)
Outra
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Wiklund, F
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Cussenot, O
(Autor)
Outra
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Berndt, SI
(Autor)
Outra
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Koutros, S
(Autor)
Outra
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Sorensen, KD
(Autor)
Outra
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Cybulski, C
(Autor)
Outra
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Grindedal, EM
(Autor)
Outra
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Park, JY
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Ingles, SA
(Autor)
Outra
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Maier, C
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Hamilton, RJ
(Autor)
Outra
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Rosenstein, BS
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Vega, A
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Kogevinas, M
(Autor)
Outra
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Penney, KL
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Manuel R Teixeira
(Autor)
ICBAS
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Brenner, H
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
John, EM
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Kaneva, R
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Logothetis, CJ
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Neuhausen, SL
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Razack, A
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Revista
Vol. 24
Páginas: 532-541
ISSN: 1365-7852
Editora: Springer Nature
Outras Informações
ID Authenticus: P-00T-C0B
Abstract (EN): Background Polygenic hazard scores (PHS) can identify individuals with increased risk of prostate cancer. We estimated the benefit of additional SNPs on performance of a previously validated PHS (PHS46). Materials and method 180 SNPs, shown to be previously associated with prostate cancer, were used to develop a PHS model in men with European ancestry. A machine-learning approach, LASSO-regularized Cox regression, was used to select SNPs and to estimate their coefficients in the training set (75,596 men). Performance of the resulting model was evaluated in the testing/validation set (6,411 men) with two metrics: (1) hazard ratios (HRs) and (2) positive predictive value (PPV) of prostate-specific antigen (PSA) testing. HRs were estimated between individuals with PHS in the top 5% to those in the middle 40% (HR95/50), top 20% to bottom 20% (HR80/20), and bottom 20% to middle 40% (HR20/50). PPV was calculated for the top 20% (PPV80) and top 5% (PPV95) of PHS as the fraction of individuals with elevated PSA that were diagnosed with clinically significant prostate cancer on biopsy. Results 166 SNPs had non-zero coefficients in the Cox model (PHS166). All HR metrics showed significant improvements for PHS166 compared to PHS46: HR95/50 increased from 3.72 to 5.09, HR80/20 increased from 6.12 to 9.45, and HR20/50 decreased from 0.41 to 0.34. By contrast, no significant differences were observed in PPV of PSA testing for clinically significant prostate cancer. Conclusions Incorporating 120 additional SNPs (PHS166 vs PHS46) significantly improved HRs for prostate cancer, while PPV of PSA testing remained the same.
Idioma: Inglês
Tipo (Avaliação Docente): Científica
Nº de páginas: 10
Documentos
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