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Publicações

First genome-wide CNV mapping in FELIS CATUS using next generation sequencing data

Título
First genome-wide CNV mapping in FELIS CATUS using next generation sequencing data
Tipo
Artigo em Revista Científica Internacional
Ano
2018
Autores
Genova, F
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Longeri, M
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Lyons, LA
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Bagnato, A
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Gandolfi, B
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Aberdein, D
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Alves, PC
(Autor)
FCUP
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Barsh, GS
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Beale, HC
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Bergström, TF
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Boyko, AR
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Brockman, JA
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Castelhano, MG
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Chan, PP
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Davis, BW
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Distl, O
(Autor)
Outra
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Dodman, NH
(Autor)
Outra
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Matthew Ellinwood, N
(Autor)
Outra
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Fogle, JE
(Autor)
Outra
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Forman, OP
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Garrick, DJ
(Autor)
Outra
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Häggström, J
(Autor)
Outra
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Helps, CR
(Autor)
Outra
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Hytönen, MK
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Ibrahim, DM
(Autor)
Outra
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Kaukonen, M
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Kaelin, CB
(Autor)
Outra
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Leclerc, E
(Autor)
Outra
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Lear, TL
(Autor)
Outra
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Leeb, T
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Lohi, H
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Lupiáñez, DG
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Magnuson, MA
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Malik, R
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Montague, MJ
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Munday, JS
(Autor)
Outra
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Murphy, WJ
(Autor)
Outra
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Ostrander, EA
(Autor)
Outra
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Pedersen, NC
(Autor)
Outra
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Petersen Jones, SM
(Autor)
Outra
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Rothschild, MF
(Autor)
Outra
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Shapiro, B
(Autor)
Outra
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Stern, JA
(Autor)
Outra
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Swanson, WF
(Autor)
Outra
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Terio, KA
(Autor)
Outra
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Todhunter, RJ
(Autor)
Outra
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Ueda, Y
(Autor)
Outra
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Warren, WC
(Autor)
Outra
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Wilcox, EA
(Autor)
Outra
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Wildschutte, JH
(Autor)
Outra
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Ginns, EI
(Autor)
Outra
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Strillacci, MG
(Autor)
Outra
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Revista
Título: BMC GenomicsImportada do Authenticus Pesquisar Publicações da Revista
Vol. 19
ISSN: 1471-2164
Editora: Springer Nature
Indexação
Outras Informações
ID Authenticus: P-00T-D7Q
Abstract (EN): Background: Copy Number Variations (CNVs) have becoming very significant variants, representing a major source of genomic variation. CNVs involvement in phenotypic expression and different diseases has been widely demonstrated in humans as well as in many domestic animals. However, genome wide investigation on these structural variations is still missing in Felis catus. The present work is the first CNV mapping from a large data set of Next Generation Sequencing (NGS) data in the domestic cat, performed within the 99 Lives Consortium. Results: Reads have been mapped on the reference assembly-6.2 by Maverix Biomics. CNV detection with cn.MOPS and CNVnator detected 592 CNVs. These CNVs were used to obtain 154 CNV Regions (CNVRs) with BedTools, including 62 singletons. CNVRs covered 0.26% of the total cat genome with 129 losses, 19 gains and 6 complexes. Cluster Analysis and Principal Component Analysis of the detected CNVRs showed that breeds tend to cluster together as well as cats sharing the same geographical origins. The 46 genes identified within the CNVRs were annotated. Conclusion: This study has improved the genomic characterization of 14 cat breeds and has provided CNVs information that can be used for studies of traits in cats. It can be considered a sound starting point for genomic CNVs identification in this species. © 2018 The Author(s).
Idioma: Inglês
Tipo (Avaliação Docente): Científica
Documentos
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