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Publicações

Landscape genomics and biased FST approaches reveal single nucleotide polymorphisms under selection in goat breeds of North-East Mediterranean

Título
Landscape genomics and biased FST approaches reveal single nucleotide polymorphisms under selection in goat breeds of North-East Mediterranean
Tipo
Artigo em Revista Científica Internacional
Ano
2009
Autores
pariset, l
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
joost, s
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
marsan, pa
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
valentini, a
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
abo-shehada, m
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
jamil, at
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
angiolillo, a
(Autor)
Outra
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baret, p
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
baumung, r
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
beja-pereira, a
(Autor)
Outra
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bertaglia, m
(Autor)
Outra
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bordonaro, s
(Autor)
Outra
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bruford, m
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
caloz, r
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
canali, g
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
canon, j
(Autor)
Outra
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cappuccio, i
(Autor)
Outra
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carta, a
(Autor)
Outra
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cicogna, m
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
crepaldi, p
(Autor)
Outra
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dalamitra, s
(Autor)
Outra
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krugmann, d
(Autor)
Outra
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petrit, d
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
popielarczyk, d
(Autor)
Outra
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susana, d
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
durso, g
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
el-barody, maa
(Autor)
Outra
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england, p
(Autor)
Outra
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erhardt, g
(Autor)
Outra
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ertugrul, o
(Autor)
Outra
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eva-maria, p
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
eveline, i-a
(Autor)
Outra
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ewa, s
(Autor)
Outra
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fadlaoui, a
(Autor)
Outra
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fornarelli, f
(Autor)
Outra
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garcia, d
(Autor)
Outra
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georgoudis, a
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
gesine, l
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
giovenzana, s
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
gutscher, k
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
hewitt, g
(Autor)
Outra
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hoda, a
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
horst, b
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
istvan, a
(Autor)
Outra
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juma, g
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
joost, s
(Autor)
Outra
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jones, s
(Autor)
Outra
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karetsou, k
(Autor)
Outra
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kliambas, g
(Autor)
Outra
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koban, e
(Autor)
Outra
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kutita, o
(Autor)
Outra
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lazlo, f
(Autor)
Outra
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lenstra, ja
(Autor)
Outra
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ligda, c
(Autor)
Outra
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lipsky, s
(Autor)
Outra
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luikart, g
(Autor)
Outra
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marie-louise, g
(Autor)
Outra
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marilli, m
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
marletta, d
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
milanesi, e
(Autor)
Outra
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negrini, r
(Autor)
Outra
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nijman, ij
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
obexer-ruff, g
(Autor)
Outra
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papachristoforou, c
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
pariset, l
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
pellecchia, m
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
peter, c
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
perez, t
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
pietrolà, e
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
pilla, f
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
roman, n
(Autor)
Outra
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roosen, j
(Autor)
Outra
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scarpa, r
(Autor)
Outra
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sechi, t
(Autor)
Outra
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taberlet, p
(Autor)
Outra
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taylor, m
(Autor)
Outra
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togan, i
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
trommetter, m
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
van, c
(Autor)
Outra
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lisette, m
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
vlaic, a
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
wiskin, l
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
zundel, s
(Autor)
Outra
A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. A pessoa não pertence à instituição. Sem AUTHENTICUS Sem ORCID
Revista
Título: BMC GeneticsImportada do Authenticus Pesquisar Publicações da Revista
Vol. 10
Página Final: 7
ISSN: 1471-2156
Editora: Springer Nature
Outras Informações
ID Authenticus: P-007-Q06
Abstract (EN): Background: In this study we compare outlier loci detected using a FST based method with those identified by a recently described method based on spatial analysis (SAM). We tested a panel of single nucleotide polymorphisms (SNPs) previously genotyped in individuals of goat breeds of southern areas of the Mediterranean basin (Italy, Greece and Albania). We evaluate how the SAM method performs with SNPs, which are increasingly employed due to their high number, low cost and easy of scoring. Results: The combined use of the two outlier detection approaches, never tested before using SNP polymorphisms, resulted in the identification of the same three loci involved in milk and meat quality data by using the two methods, while the FST based method identified 3 more loci as under selection sweep in the breeds examined. Conclusion: Data appear congruent by using the two methods for FST values exceeding the 99% confidence limits. The methods of FST and SAM can independently detect signatures of selection and therefore can reduce the probability of finding false positives if employed together. The outlier loci identified in this study could indicate adaptive variation in the analysed species, characterized by a large range of climatic conditions in the rearing areas and by a history of intense trade, that implies plasticity in adapting to new environments.
Idioma: Inglês
Tipo (Avaliação Docente): Científica
Nº de páginas: 8
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