O ecossistema de I&D+i da U.Porto está estruturado, internamente, em torno de Unidades Orgânicas, Institutos de Investigação associados e Centros Funcionais e de Competência.
A Universidade participa ainda em Laboratórios Associados (LA) e Laboratórios Colaborativos (CoLAB), bem como em Infraestruturas de Investigação, que integram o Roteiro Nacional das Infraestruturas de Investigação de Interesse Estratégico (RNIE) da Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT), entre outros.
Esta estrutura dinâmica, que abrange diversas áreas de investigação, está empenhada em apoiar e incentivar a produção de conhecimento que dê resposta aos principais desafios científicos e societais da atualidade.