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Cursos

Rastreios em larga escala e análise de imagem para as Ciências Biológicas

Com esta formação pretende-se dinamizar a aquisição de conhecimento numa área inovadora e em franca expansão – o rastreio de alto rendimento. A sua acreditação como formação contínua permitirá assegurar o interesse, a eficácia e a qualidade da formação realizada, e promoverá a interdisciplinaridade dentro da UP, particularmente nas áreas de Engenharia e das Ciências Biológicas e Biomédicas.

Com uma duração total de 5 dias, esta formação tem uma orientação fundamentalmente prática, encorajando os participantes à utilização de diferentes técnicas de aquisição massiva de imagens e à análise específica das imagens obtidas com recursos aos diversos softwares disponíveis.

Tendo a possibilidade de interagir com especialistas internacionais na área da análise de imagem, o objetivo fulcral desta unidade de formação é permitir que os participantes adquiram conhecimentos para desenhar, realizar e interpretar experiências onde seja fundamental a análise de imagem em geral e a citometria de fluxo com capacidade de aquisição de imagens e microscopia de high content em particular.

Objetivos:

Pretende-se que os participantes adquiram as seguintes competências:

- Uma visão integradora da aplicação da bioimagem na investigação nas áreas da medicina regenerativa, biomateriais e ciências biológicas;

- Conhecimentos aprofundados sobre uma ferramenta nova de aquisição e análise de imagem aplicadas às áreas da biologia celular, imunologia, engenharia de tecidos, biomateriais, modelos pré-clínicos, etc.;

- Destreza no planeamento e realização de experiências utilizando as técnicas de citometria de fluxo com capacidade de aquisição de imagens (Imagestream) e de microscopia de high content (IN Cell Analyzer 2000);

- Analisar e interpretar os resultados obtidos na análise das imagens com recurso aos softwares específicos de cada equipamento e também outros dois softwares amplamente difundidos na comunidade científica para análise de imagem de microscopia: ImageJ e Cell profiler.

Programa:

  • Fundamentos e utilização do citómetro de fluxo com capacidade de aquisição de imagens (Imagestream). Formação no software INSPIRE para adquisição de amostras.
  • Fundamentos e utilização do microscópio de high content (IN Cell Analyzer 2000). Formação no software específico do equipamento para aquisição de amostras.

  • Fundamentos e utilização do software de análise de imagens adquiridas no imagestream com o software IDEAS (software próprio do equipamento). Este software é completamente gratuito na sua versão completa para toda a comunidade científica.

  • Fundamentos e utilização do software de análise de imagens adquiridas no IN Cell Analyzer 2000 com o software próprio do equipamento.

  • Introdução à utilização do software ImageJ para a análise de imagens obtidas com o Imagestream e IN Cell Analyzer (batch analysis entre outros). Práticas com os exemplos analisados nos softwares dos equipamentos.

  • Fundamentos de utilização do software cell profiler para a análise de imagens obtidas com o Imagestream e IN Cell Analyzer (machine learning entre outros). Práticas com os exemplos analisados nos softwares dos equipamentos.

  • Fundamentos de preparação e desenvolvimento de projetos, na área de rastreios químicos e genéticos de larga escala.

Destinatários:
Esta formação foi concebida para todos os estudantes/investigadores das áreas de Medicina Regenerativa, Engenharia Biomédica, Biomateriais, Bioengenharia, Neurociências, Oncobiologia, Biologia Celular e Análise de Imagem.

Está aberta à participação de estudantes de pós-graduação (Mestrado, Programa doutoral) e investigadores das referidas áreas, provenientes de laboratórios de investigação, instituições de ensino superior e empresas.

Condições de acesso:
Formação universitária em áreas afins a Medicina Regenerativa, Engenharia Biomédica, Biomateriais, Biologia Celular e Análise de Imagem.

Os candidatos deverão estar inscritos em mestrado ou programa doutoral.

Os candidatos serão selecionados de acordo com o currículo e carta de motivação apresentados aquando da candidatura. Como critério principal será dada preferência aqueles candidatos para os quais a utilização dos equipamentos e a formação na análise de imagem sejam fundamentais para o seu trabalho de investigação.

Os candidatos serão avaliados pelo CV e a carta de motivação com uma avaliação máxima de 4 pontos, soma dos valores obtidos para cada um dos critérios mencionados a seguir:

  1. Candidato com formação universitária nas áreas da Medicina Regenerativa, Engenharia Biomédica, Biomateriais, Bioengenharia, Neurociências, Oncobiologia, Biologia Celular e Análise de Imagem.
  2. Candidato inscrito em mestrado ou programa doutoral.
  3. Candidato inscrito em mestrado ou programa doutoral nas áreas identificadas no critério 1.
  4. Candidato cujo projeto de investigação beneficie com a aprendizagem das técnicas alvo da presente formação.

Cada critério será avaliado com um valor de 1 quando o candidato satisfaça o critério, e de 0 em caso contrario.

Avaliação e certificação:

A avaliação dos estudantes será efetuada através de Prova de avaliação, sendo a classificação positiva expressa na escala de 10 a 20 (nº 10, artº 5º do Regulamento de criação de cursos da UP).

A presença é obrigatória nos cinco dias da formação, sendo essencial para poder realizar a prova de avaliação.

Créditos: 2 ECTS (Creditado pela UP em 2017.06.06)

Duração: 54 h (36 h de contato)

Datas:
18 a 22 de junho de 2018

Local:
i3S - Instituto de Investigação e Inovação em Saúde
Universidade do Porto - Campus da Asperela
Rua Alfredo Allen, 208
4200-135 Porto, Portugal

Participantes: 30 (máximo) 15 (mínimo)

Custo: 250¤

Mais informações:
Email: b.image@ineb.up.pt (Dr Maria Lázaro)
Telefone: +351-220408800 (Dr Maria Lázaro)
Website: https://www.i3s.up.pt/content/training?v=15


Dados Gerais

Docente Responsável: Fernando Mendes Monteiro
Sigla: RLEAICB
Tipo de curso/ciclo de estudos: Unidade de Formação Contínua
Início: 2017/2018
Duração: 36 Horas

Planos de Estudos

Diplomas

  • Rastreios em larga escala e análise de imagem para as Ciências Biológicas (2 Créditos ECTS)

Áreas Científicas Predominantes

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