BIOL4015 - ECTS

 

Os objectivos principais desta disciplina são fornecer aos alunos capacidade de lidar com todas as ferramentas bio-informáticas disponíveis para a planta que é considerada o modelo de estudo em biologia molecular.

Familiarizarem-se com técnicas avançadas de transformação de plantas, manuseamento de mutantes nulos simples e duplos e mutantes com genes marcados com diferentes tags. Recorrer a técnicas de emasculação e polinização de plantas, estudos semi in vivo do crescimento do tubo polínico e visualização de marcadores moleculares por microscopia de fluorescência e electrónica. Avaliação de resultados de Real Time-PCR e avaliação de resultados de RNA-seq.

Os alunos ficarão preparados para fazerem estágio em qualquer laboratório de Biologia Molecular assim como ficarão a par dos resultados mais recentes em Biologia da Reprodução de Plantas.

 

BIOL4009 - ECTS

Esta UC dá a conhecer aos estudantes as abordagens moleculares, genómicas, bioquímicas, de biologia celular e computacionais para entender a fisiologia e desenvolvimento das plantas a nível molecular. São abordadas também as aplicações biotecnológicas potenciadas pelas ferramentas moleculares.

BIOL4005 - ECTS

Compreender como crescem as árvores, a relação entre a estrutura da madeira e as propriedades específicas dos seus derivados; conhecer e aplicar os métodos de identificação de madeiras; compreender a importância da madeira enquanto recurso natural e matéria industrial e a sua importância nas diferentes sociedades.

 

BIOL4003 - ECTS Os objetivos desta unidade curricular são a obtenção de conhecimentos sobre as possibilidades de desenvolver produtos a partir das algas e cianobactérias, e de quais as principais passos e desafios para este desenvolvimento. Obtenção de conhecimentos sobre o potencial das algas e cianobactérias para utilizações biotecnológicas, como se faz a  manipulação genética, bioprospecção, seleção, e produção de micro e macroalgas e como se processam os principais produtos atuais e potenciais de algas e cianobactérias.

B4059 - ECTS

A maioria dos biólogos aborda o desenho experimental de maneira informal, ou ad hoc, refinando as suas experiências de forma empírica, numa base de tentativa-erro. Durante o curso será dada especial relevância à lógica subjacente a todo o processo experimental, desde a elaboração de hipóteses, selecção de testes estatísticos adequados às hipóteses em causa, planeamento e concepção da experiência e interpretação de resultados.

BIOL4001 - ECTS

Fornecer conceitos avançados sobre manipulação de DNA, tecnologia de DNA recombinante, PCR, clonagem e suas aplicações na transformação genética de plantas, na perspectiva de obtenção de proteínas recombinantes. Utilização de ferramentas básicas de bioinformática no planeamento experimental para a obtenção de proteínas recombinantes (BLAST search, análise de sequências, optimização de genes, desenho de primers). Prática laboratorial incidindo na clonagem de genes em vectores de expressão adequados contendo tags e proteínas de fusão, e transformação de estirpes bacterianas geneticamente adequadas.

BIOL4006 - ECTS O objetivo geral deste curso é dar aos estudantes uma compreensão mais profunda de como ocorre a regulação da expressão dos genes das plantas eucariontes, incluindo todos os eventos moleculares que decorrem desde a regulação da atividade promotora até à tradução do mRNA, passando pela regulação da estabilidade e durabilidade do mRNA e todos os eventos celulares que lhe são subjacentes (splicings, regulação pelo RNA de interferência (RNAi) e os vários mecanismos citoplasmáticos de controlo pós-transcrição). Como competências e resultados de aprendizagem, pretende-se que os estudantes se tornem capazes de compreender os mecanismos moleculares subjacentes à produção, manutenção e eficiência da tradução de mRNAs, tornando-se assim conscientes das necessidades, cuidados e estratégias a ter em vários procedimentos como, por exemplo, a produção de plantas geneticamente modificadas, ou a análise de acumulação de transcritos e/ou dos produtos por eles codificados.

BIOL4004 - ECTS

Objetivos - aquisição de conhecimentos sobre os processos fisiológicos e bioquímicos subjacentes aos danos causados por stresses abióticos e bióticos e sobre as respostas de aclimatação e de adaptação das plantas; identificar estratégias para aumentar a tolerância das plantas a diferentes tipos de stress.
Após conclusão da UC, o estudante deverá ser capaz de:

- compreender aspetos da fisiologia das plantas envolvidos nas interações planta-meio

- reconhecer a influência do clima e solo nas plantas

 - explicar como fatores ambientais podem ser responsáveis por graves situações de stress

- reconhecer as principais respostas e adaptações das plantas a diferentes situações de stress

- conhecer os principais mecanismos fisiológicos e bioquímicos que protegem as plantas contra stresses

- compreender a importância da UC para a resolução de problemas ambientais no atual contexto de alterações climáticas

BIOL4013 - ECTS

Com esta UC pretende-se dotar os estudantes com conhecimentos sólidos sobre as potencialidades de plantas aromáticas e medicinais (PAM) para obtenção de produtos de elevado valor acrescentado por processos biotecnológicos específicos. Para este desiderato são traçados os seguintes objetivos:

(a) Perceção dos mecanismos de defesa das plantas contra fatores ambientais abióticos e bióticos adversos baseados em metabolitos secundários;

(b) Perceção das aplicações dos metabolitos secundários baseadas nas respetivas atividades biológicas;

(c) Compreensão das capacidades e limitações de produção de metabolitos secundários de elevado valor económico por culturas de células, tecidos e órgãos vegetais;

(d) Compreensão das diversas técnicas e metodologias que envolvem culturas de plantas aromáticas e medicinais para produção biotecnológica de compostos de elevado valor comercial, designadamente:
d.1 – culturas em meio sólido e em meio líquido em sistema “batch” e em sistema contínuo, com recurso a bioreatores;
d.2 – técnicas de elicitação;
d.3 – técnicas envolvendo DNA recombinante;
d.4 – processos de imobilização de moléculas, células, meristemas e embriões somáticos;
d.5 – processos de produção de sementes artificiais;
d.6 – processos de conservação / criopreservação.

BIOL4050 - ECTS Fornecer conhecimentos atuais sobre a biotecnologia de sementes e o tipo de investigação que se pode fazer de modo a produzir futuros líderes na indústria de sementes. Pretende-se que os alunos dominem a biologia das sementes; estrutura, fisiologia e genética, de modo a serem capazes de apresentar projetos de investigação de ponta em agricultura sustentável, biotecnologia, utilização de culturas e biologia molecular.

BIOL4054 - ECTS

A unidade curricular (UC) tem por objetivo geral desenvolver competências na criação de projetos de utilização das plantas para fins biotecnológicos, integrando uma componente teórica e uma forte componente de apresentação de casos de estudos e projectos, nacionais e internacionais, em desenvolvimento nessa área.

A UC tem por objetivo específico dar a conhecer as potencialidades e multifuncionalidades das coberturas verdes e capacitar os estudantes para a utilização dos diferentes materiais e possibilidades de aplicação destes sistemas no contexto atual de mitigação e adaptação às alterações climáticas.

É ainda objectivo específico da UC dar a conhecer os conceitos básicos em fitoremediação, os vários fatores bióticos e abióticos que podem limitar o sucesso dos processos de bio/fitoremediação e as especificidades de cada sistema.

Faz parte dos objectivos específicos desta UC a compreensão de fitotecnologias baseadas na interação entre plantas e microrganismos que melhoram o desempenho das plantas utilizadas para a recuperação de solos degradados e no aumento da produtividade vegetal, soluções sustentáveis com o objetivo de aumentar a produtividade das plantas e, ao mesmo tempo, reduzir as taxas de aplicação de fertilizantes químicos.

Será também objectivo da UC a apresentação de vários modelos de biomarcadores, baseados em plantas transgénicas, usadas com sucesso na biomonitorização de poluentes, os benefícios e possíveis desvantagens desses sistemas e ideias novas para as futuras gerações de fitosensores.

Após conclusão da UC, o estudante deve ser capaz de:

- Compreender a importancia das plantas como formas tecnologicas de preservação e remediação do meio ambiente (Biotecnologia verde).

- Classificar e caracterizar os diferentes tipos de coberturas verdes e identificar as suas vantagens ambientais/ecológicas, sociais e económicas.

- Estar capacitados para uma correta escolha e seleção dos sistemas e matérias para execução de coberturas verdes

- Compreender os principios gerais da utilização das plantas para fins de bioremediação de águas residuais ou solos e compreender as metodologias e tecnologia associada à estruturação de uma fitoetar.

- Compreender as bases teóricas inerentes à produção de biossensores e conhecer as aplicações atuais de alguns biosensores

- Conhecer as potencialidades de microorganismos com biofertilizantes e melhoradores da qualidade dos solos.

- Identificar diferentes tipos de fitotecnologias.

BIOL4002 - ECTS

Constitui objetivo desta UC a compreensão das vias de transdução de sinais que nas plantas coordenam a expressão génica com o desenvolvimento e com as respostas das plantas às condições ambientais, constituindo a base da regulação da sua fisiologia e desenvolvimento ou seja da sua Biologia Funcional.

Nesta UC é também pretendido que os estudantes entrem em contacto com a investigação que se desenvolve na UP na área da Biotecnologia e Biologia Funcional de Plantas, orientando-os quanto à escolha do seu tema de dissertação.

Após conclusão da unidade curricular, o estudante deverá ser capaz de:

- compreender os princípios gerais da transdução de sinais em plantas

- reconhecer as vias de sinalização intervenientes em alguns processos fisiológicos que ocorrem durante o desenvolvimento ou em resposta a alguns fatores ambientais

 - compreender a interação entre diferentes vias de sinalização

- conhecer metodologias e tecnologia usadas na investigação na área da Biologia Funcional de Plantas.

BIOL4007 - ECTS Objetivo desta UC é dar a conhecer as fitopatologias das principais culturas agrícolas e meios de controlo permitidos em diferentes modalidades de agricultura sustentável assim como projetos de investigação em curso nesta temática.

BIOL4012 - ECTS Objetivos gerais: Desenvolver uma visão integrada da estrutura e funcionamento dos genomas, transcriptomas e proteomas e conhecer as modernas metodologias associadas à genómica funcional, incluindo sequenciação, anotação, análise in silico de bases de dados funcionais, transcriptómica e princípios gerais de bioinformática.

Objetivos específicos:

 -Comparar os genes e /ou família de genes entre plantas  modelo como Arabidopsis thaliana e espécies de interesse agrícola; conhecer recursos de genómica comparativa.

-Utilizar as principais ferramentas de análise in silico/bioinformáticas para a caracterização de genes e proteínas em plantas.

-Analisar dados de expressão de genes por RNA-Seq  de forma a caracterizar genes diferencialmente expressos
Utilizar ferramentas de interpretação e análise de dados de proteómica. Caracterizar proteínas quanto a: parâmetros bioquímicos, previsão de localização subcelular e de modificações pós-traducionais - fosforilações e glicosilações; previsão de estrutura 3D.. 

-Conhecer princípios fundamentais da análise bioinformática; experimentar a utilização de linhas de comandos em ambiente LINUX.

BIOL4011 - ECTS

A unidade curricular tem por objetivo desenvolver competências na área da criação de novos projectos empresariais na área das ciências da vida, integrando uma componente teórica e uma forte componente prática. A apresentação e discussão de conceitos e metodologias, terá como objectivo a sua aplicação na validação do potencial de mercado de um projecto empresarial concreto na área das biociências, criado pelos estudantes.

No final da unidade curricular, os estudantes devem:

1. Compreender os desafios do processo de criação, validação e arranque de novos projectos empresariais;
2. Conhecer as diferentes áreas funcionais da gestão e a forma como se interligam na definição estratégia de uma startup de base tecnológica.
3. Ser capazes de aplicar um conjunto de conceitos, métodos e ferramentas de gestão à análise, discussão e execução de projectos empresariais de conhecimento intensivo na área das ciências da vida.

Ser capazes de desenvolver trabalho em equipa.

BIOL4010 - ECTS

Fornecer aos alunos conhecimentos básicos sobre culturas de células vegetais in vitro e aplicações práticas, nomeadamente micropropagação e transformação de plantas.
Fornecer aos alunos conhecimentos básicos de manipulação em assépsia.

BIOL4019 - ECTS

Durante um período normal de 1 ano, e como peça basilar da sua formação, o estudante deverá desenvolver um projecto de investigação original num domínio fundamental ou aplicado da Biotecnologia ou Biologia Funcional de Plantas. Deste trabalho resultará a elaboração de uma dissertação final que constituirá a peça fundamental da avaliação do estudante. Deste trabalho deverão resultar ainda publicações em revistas internacionais com sistema de arbitragem científica.

Alternativa o estudante poderá realizar um estágio numa empresa e elaborar um relatório final que constituirá a base da sua avaliação.

BIOL4020 - ECTS

Durante um período normal de 1 ano, e como peça basilar da sua formação, o estudante deverá desenvolver um projecto de investigação num domínio fundamental ou aplicado da Biotecnologia ou Biologia Funcional de Plantas no âmbito empresarial. Deste trabalho resultará a elaboração de um  elatório final que constituirá a peça fundamental da avaliação do estudante. Deste trabalhopoderão resultar ainda publicações em revistas internacionais com sistema de arbitragem científica.

 

BIOL4017 - ECTS

A UC projecto tem como objectivo fundamental o desenvolvimento teórico daquele que deverá vir a constituir o projecto de investigação conducente à elaboração da dissertação de mestrado. Nesta UC será desenvolvido no estudante aptidões e competências para a elaboração de um projecto científico com uma forte componente experimental numa área adequada ao âmbito do CE.

BIOL4018 - ECTS

A UC projecto de estágio tem como objectivo fundamental o desenvolvimento teórico daquele que deverá vir a constituir o projecto de estágio conducente à elaboração do relatório de estágio de mestrado. Nesta UC será desenvolvido no estudante aptidões e competências para a elaboração de um projecto científico com uma forte componente experimental numa área adequada ao âmbito do CE.