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Toxicogenómica e Toxicoproteómica

Código: TCAEM18     Sigla: TT

Áreas Científicas
Classificação Área Científica
OFICIAL Biologia

Ocorrência: 2021/2022 - 2S

Ativa? Sim
Unidade Responsável: Departamento de Biologia
Curso/CE Responsável: Mestrado em Toxicologia e Contaminação Ambientais

Ciclos de Estudo/Cursos

Sigla Nº de Estudantes Plano de Estudos Anos Curriculares Créditos UCN Créditos ECTS Horas de Contacto Horas Totais
MTCAEM 13 Plano Oficial 2020 1 - 6 42 162

Docência - Responsabilidades

Docente Responsabilidade
Agostinho Antunes Pereira Regente
Alexandre Marnoto de Oliveira Campos Regente

Docência - Horas

Teórica: 1,30
Práticas Laboratoriais: 1,70
Tipo Docente Turmas Horas
Teórica Totais 1 1,30
Agostinho Antunes Pereira 0,65
Alexandre Marnoto de Oliveira Campos 0,65
Práticas Laboratoriais Totais 1 1,70
Agostinho Antunes Pereira 0,85
Alexandre Marnoto de Oliveira Campos 0,85

Língua de trabalho

Português e inglês

Objetivos

Pretende-se que os estudantes ganhem conhecimentos, teóricos e práticos, ao nível das novas tecnologias para a análise da expressão de genes e proteínas e sua aplicação às ciências do ambiente e toxicologia. Os estudantes devem ainda tomar conhecimento das diferentes tecnologias disponíveis atualmente, as principais diferenças entre cada tecnologia, o tipo de informação que podem fornecer ao investigador e em que contextos deverão ser utilizadas.

Resultados de aprendizagem e competências

Os objetivos da UC têm por base a aprendizagem dos conceitos de genoma/proteoma e genómica/proteómica, bem como dos conceitos de identificação de genes e separação de proteínas em amostras biológicas complexas, a espectrometria de massa e interpretação dos dados moleculares em estudos de caso em toxicologia. Neste sentido os conteúdos programáticos contemplados no plano das aulas abordam todos estes aspetos da aprendizagem e permitem aos estudantes a experimentação com dados reais e trabalho laboratorial, de forma a consolidar conhecimentos.

Modo de trabalho

Presencial

Programa

Nesta UC são abordados os seguintes conteúdos,

  1. Definição e objetivos da genómica e proteómica aplicada à toxicologia
  2. Apresentação das principais estratégias de estudo do genoma e proteoma
  3. Bases de dados e ferramentas de pesquisa de dados
  4. Apresentação dos princípios de espectrometria de massa e identificação de proteínas
  5. Desenho experimental e análise de dados de genómica e proteómica
  6. Sequenciação de DNA, identificação de genes e filogenética de genes/proteínas
  7. Treino teórico e prático sobre a identificação de proteínas usando ferramentas de bioinformática, extração de proteínas de amostras biológicas e sua separação em gel de poliacrilamida

Bibliografia Obrigatória

Mushegian Arcady R.; Foundations of comparative genomics. ISBN: 9780120887941
Liebler Daniel C.; Introduction to proteomics. ISBN: 0-89603-992-7

Bibliografia Complementar

Akay Metin 340; Genomics and proteomics engineering in medicine and biology. ISBN: 0-471-63181-7
Urfer Wolfgang, ed. lit.; Statistics in genomics and proteomics. ISBN: 989-95011-0-7

Métodos de ensino e atividades de aprendizagem

O ensino da genómica e proteómica é composto por aulas teóricas, onde serão apresentados aos estudantes, de forma mais descritiva, os conteúdos programáticos, bem como aulas teórico-práticas. As aulas teórico-práticas têm como principal objetivo a consolidação dos conhecimentos já adquiridos com casos de estudo aplicados à toxicologia ( exercícios, com recurso a ferramentas de bioinformática disponibilizadas online) e aulas realizadas em laboratório com a realização de um protocolo experimental. Este trabalho permite verificar as competências e o interesse dos estudantes para o trabalho mais técnico em laboratório.

A avaliação da UC faz-se com recurso a um exame escrito e trabalho escrito, que foca sobretudo os conteúdos teóricos e teórico-práticos adquiridos.

Palavras Chave

Ciências Naturais > Ciências do ambiente
Ciências Naturais > Ciências biológicas > Biologia

Tipo de avaliação

Avaliação por exame final

Componentes de Avaliação

Designação Peso (%)
Exame 80,00
Trabalho escrito 20,00
Total: 100,00

Componentes de Ocupação

Designação Tempo (Horas)
Frequência das aulas 100,00
Trabalho escrito 20,00
Total: 120,00

Obtenção de frequência

Frequência das aulas da UC e trabalho escrito.

Fórmula de cálculo da classificação final

Exame final (escala de 0 a 20 valores) - 80%
Trabalho escrito - 20%

Observações

Professor de contacto: Agostinho Antunes
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