A FFUP é parceiro e alberga diversas unidades de investigação, nomeadamente:
CEQUIMED-UP - Centro de Química Medicinal da Universidade do Porto, que envolve o Serviço de Química Orgânica.
CEQUP - Centro de Química da Universidade do Porto integrado no Laboratório associado REQUIMTE.
FARMA - grupo de investigação na área da Farmacologia, que envolve o Serviço de Farmacologia.
GABAI - grupo de análises bioquímicas, ambientais e industriais, que envolve o Serviço de Química-Física.
GEB - grupo de estudos biotoxicológicos, que envolve o Serviço de Toxicologia.
GRESA - grupo de estudos de segurança alimentar, que envolve o Serviço de Bromatologia.
GREF - grupo de estudos de Fitoquímica, que envolve o Serviço de Farmacognosia.
Diversos docentes da FFUP desenvolvem ainda actividade em unidades de investigação que funcionam fora da mesma, como acontece com docentes do Serviço de Bioquímica e de Microbiologia cuja actividade de investigação se efectua maioritariamente, respectivamente, no Instituto de Biologia Molecular e Celular ( IBMC ) e no Instituto de Patologia e Imunologia Molecular da Universidade do Porto ( IPATIMUP) da Universidade do Porto.
Do ponto de vista de produção científica a FFUP tem ocupado os primeiros lugares do ranking da UP em número de publicações indexadas na “Web of Science”.
A FFUP, através dos seus docentes, colabora ainda com outras instituições na leccionação do:
Mestrado em Tecnologias do Medicamento da Faculdade de Farmácia da Universidade de Coimbra;
Programa de Educação Médica Contínua em Medicina Molecular da Faculdade Medicina da Universidade do Porto;
Programa de Doutoramento GABBA da Universidade do Porto
Mestrado em Toxicologia Forense da Universidade do Porto
Curso de Pós-Graduação em Análises Clínicas da Universidade de Coimbra
Para mais informações sobre a investigação desenvolvida nos vários Serviços da Faculdade, pode consultar as páginas que já estão disponíveis.