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Engenharia Metabólica e Biomolecular

Código: M.BIO038     Sigla: EMB

Áreas Científicas
Classificação Área Científica
OFICIAL Bioengenharia Molecular

Ocorrência: 2024/2025 - 1S Ícone do Moodle

Ativa? Sim
Unidade Responsável: Departamento de Engenharia Química e Biológica
Curso/CE Responsável: Mestrado em Bioengenharia

Ciclos de Estudo/Cursos

Sigla Nº de Estudantes Plano de Estudos Anos Curriculares Créditos UCN Créditos ECTS Horas de Contacto Horas Totais
M.BIO 23 Plano de estudos oficial 1 - 6 58,5 162
M.EQ 10 Plano Oficial do ano letivo 2 - 6 58,5 162

Docência - Responsabilidades

Docente Responsabilidade
Nuno Filipe Ribeiro Pinto de Oliveira Azevedo Regente

Docência - Horas

Teórico-Práticas: 3,00
Práticas Laboratoriais: 1,50
Tipo Docente Turmas Horas
Teórico-Práticas Totais 1 3,00
Nuno Filipe Ribeiro Pinto de Oliveira Azevedo 3,00
Práticas Laboratoriais Totais 1 1,50
Andreia Sofia Mateus Azevedo 1,50

Língua de trabalho

Português
Obs.: Português - Suitable for English-speaking students

Objetivos

Fornecer aos estudantes as competências necessárias à quantificação dos fluxos metabólicos através da utilização de metodologias baseadas em modelos cinéticos e estequiométricos. Conferir aos estudantes proficiência na utilização de ferramentas informáticas para análise e simulação destes processos.

Resultados de aprendizagem e competências

-Compreender a importância da engenharia metabólica na bioengenharia moderna

-Conhecer os principais modelos matemáticos de análise de sistemas metabólicos e celulares

-Desenvolver competências na análise biomatemática de redes metabólicas

-Desenvolver competências na análise biomatemática de fluxos metabólicos

-Adquirir conhecimentos e desenvolver competências na utilização de bases de dados em engenharia metabólica

 

Modo de trabalho

Presencial

Pré-requisitos (conhecimentos prévios) e co-requisitos (conhecimentos simultâneos)

n.a.

Programa

Apresentação de conceitos

- Engenharia metabólica; Ómicas; Biologia de sistema; Biologia sintética

Abordagens estratégicas em engenharia metabólica e celular:


- Análise de dados de interações proteína-proteína


- Análise de redes e fluxos metabólicos


- Análise de controlo metabólico


- Ferramentas para avaliação da importância do localização intracelular dos vários componentes celulares


-Métodos analíticos em engenharia metabólica

Bases de dados em biotecnologia

Aplicações emergentes de engenharia metabólica



Componente prática - Bioinformática:


- Introdução à bioinformática


- Aplicação de software para análise de sequências de ácidos nucleicos


- Geração da matriz estequiométrica e cálculo de fluxos


- Utilização de bases de dados em biotecnologia e ferramentas computacionais em engenharia metabólica


-Predição quantitativa do metabolismo celular com base em modelos de restrição


-Ferramentas para otimização em engenharia metabólica

Bibliografia Obrigatória

Eberhard Voit ; A First Course in Systems Biology, Garland Science, 2012. ISBN: 9780815344674
Stephanopoulos G N, Aristidou A A, Nielsen J; Metabolic engineering: principles and methodologies. , Academic Press, 1998
Torres N V, Voit E O; Pathway analysis and optimization in metabolic engineering, Cambridge University Press, 2002

Bibliografia Complementar

S. Cortassa, M.A. Aon, A. A. Iglesias,... [et al.]; An introduction to metabolic and cellular engineering. ISBN: 978-981-4365-72-7

Observações Bibliográficas

n.a.

Métodos de ensino e atividades de aprendizagem

Exposição formal dos fundamentos teóricos e práticos, usando videoprojetor e material online acessível através da Internet. Desenvolvimento tutorial de alguns exemplos e resolução de problemas, com o recurso a software adequado.

 

Software

Microsoft Windows Server Standard
Matlab
Adobe

Tipo de avaliação

Avaliação distribuída com exame final

Componentes de Avaliação

Designação Peso (%)
Exame 60,00
Trabalho prático ou de projeto 40,00
Total: 100,00

Componentes de Ocupação

Designação Tempo (Horas)
Estudo autónomo 80,00
Frequência das aulas 70,00
Trabalho de investigação 12,00
Total: 162,00

Obtenção de frequência

n.a.

Fórmula de cálculo da classificação final

A classificação final será calculada de acordo com os seguintes componentes de avaliação:
Exame final (fator de ponderação de 60% na classificação final);
Apresentação oral de um tema emergente em engenharia metabólica e celular e respetivo relatório (fator de ponderação de 40% na classificação final); 

Exame de recurso.

Para obtenção de classificação positiva, o estudante deverá obter uma classificação global mínima de 9.5 valores. A classificação no exame final deverá ser superior a 8 valores.

Provas e trabalhos especiais

n.a.

Trabalho de estágio/projeto

n.a.

Avaliação especial (TE, DA, ...)

Estas situações não dispensam a realização dos trabalhos da unidade curricular. Estes têm que ser realizados no mesmo prazo que for fixado para os estudantes ordinários. A forma de avaliação é, portanto, a mesma para todos os estudantes.

Melhoria de classificação

Exame de recurso.

Observações

n.a.

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