Engenharia Metabólica e Biomolecular

Código:

M.BIO038

Sigla:

EMB

Áreas Científicas
Classificação	Área Científica
OFICIAL	Bioengenharia Molecular

Ocorrência: 2023/2024 - 1S

Ativa?	Sim
Unidade Responsável:	Departamento de Engenharia Química e Biológica
Curso/CE Responsável:	Mestrado em Bioengenharia

Ciclos de Estudo/Cursos

Sigla	Nº de Estudantes	Plano de Estudos	Anos Curriculares	Créditos UCN	Créditos ECTS	Horas de Contacto	Horas Totais
M.BIO	20	Plano de estudos oficial	1	-	6	58,5	162
M.EQ	11	Plano Oficial do ano letivo	2	-	6	58,5	162

Língua de trabalho

Português
Obs.: Português - Suitable for English-speaking students

Objetivos

Fornecer aos estudantes as competências necessárias à quantificação dos fluxos metabólicos através da utilização de metodologias baseadas em modelos cinéticos e estequiométricos. Conferir aos estudantes proficiência na utilização de ferramentas informáticas para análise e simulação destes processos.

Resultados de aprendizagem e competências

-Compreender a importância da engenharia metabólica na bioengenharia moderna

-Conhecer os principais modelos matemáticos de análise de sistemas metabólicos e celulares

-Desenvolver competências na análise biomatemática de redes metabólicas

-Desenvolver competências na análise biomatemática de fluxos metabólicos

-Adquirir conhecimentos e desenvolver competências na utilização de bases de dados em engenharia metabólica

 

Modo de trabalho

Presencial

Pré-requisitos (conhecimentos prévios) e co-requisitos (conhecimentos simultâneos)

n.a.

Programa

- Engenharia metabólica; Ómicas; Biologia de sistema; Biologia sintética

Abordagens estratégicas em engenharia metabólica e celular:

- Análise de dados de interações proteína-proteína

- Análise de redes e fluxos metabólicos

- Análise de controlo metabólico

- Ferramentas para avaliação da importância do localização intracelular dos vários componentes celulares

-Métodos analíticos em engenharia metabólica

Bases de dados em biotecnologia

Aplicações emergentes de engenharia metabólica

Componente prática - Bioinformática:

- Introdução à bioinformática

- Aplicação de software para análise de sequências de ácidos nucleicos

- Geração da matriz estequiométrica e cálculo de fluxos

- Utilização de bases de dados em biotecnologia e ferramentas computacionais em engenharia metabólica

-Predição quantitativa do metabolismo celular com base em modelos de restrição

-Ferramentas para otimização em engenharia metabólica

Bibliografia Obrigatória

Eberhard Voit ; A First Course in Systems Biology, Garland Science, 2012. ISBN: 9780815344674
Stephanopoulos G N, Aristidou A A, Nielsen J; Metabolic engineering: principles and methodologies. , Academic Press, 1998
Torres N V, Voit E O; Pathway analysis and optimization in metabolic engineering, Cambridge University Press, 2002

Bibliografia Complementar

S. Cortassa, M.A. Aon, A. A. Iglesias,... [et al.]; An introduction to metabolic and cellular engineering. ISBN: 978-981-4365-72-7

Observações Bibliográficas

n.a.

Métodos de ensino e atividades de aprendizagem

Exposição formal dos fundamentos teóricos e práticos, usando videoprojetor e material online acessível através da Internet. Desenvolvimento tutorial de alguns exemplos e resolução de problemas, com o recurso a software adequado.

 

Software

Microsoft Windows Server Standard
Matlab
Adobe

Tipo de avaliação

Avaliação distribuída com exame final

Componentes de Avaliação

Designação	Peso (%)
Exame	60,00
Trabalho prático ou de projeto	40,00
Total:	100,00

Componentes de Ocupação

Designação	Tempo (Horas)
Estudo autónomo	80,00
Frequência das aulas	70,00
Trabalho de investigação	12,00
Total:	162,00

Obtenção de frequência

n.a.

Fórmula de cálculo da classificação final

A classificação final será calculada de acordo com os seguintes componentes de avaliação:
Exame final (fator de ponderação de 60% na classificação final);
Apresentação oral de um tema emergente em engenharia metabólica e celular e respetivo relatório (fator de ponderação de 40% na classificação final); 

Exame de recurso.

Para obtenção de classificação positiva, o estudante deverá obter uma classificação global mínima de 9.5 valores. A classificação no exame final deverá ser superior a 8 valores.

Provas e trabalhos especiais

n.a.

Trabalho de estágio/projeto

n.a.

Avaliação especial (TE, DA, ...)

Estas situações não dispensam a realização dos trabalhos da unidade curricular. Estes têm que ser realizados no mesmo prazo que for fixado para os estudantes ordinários. A forma de avaliação é, portanto, a mesma para todos os estudantes.

Melhoria de classificação

Exame de recurso.

Observações

n.a.